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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002368`

染色体: Chr08 坐标: 22512968-22518268 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002368`
名称	SmilChr08G002368
描述	uncharacterized SmilChr08G002368
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22512968 - 22518268 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998198`
GeneID	`130998198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998198`
原始查询	`SmilChr08G002368`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF13456 (RVT_3); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779611.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779611.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779611.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779611.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22512970`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	114	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A19,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B110,B114,B115,B119,B122,B123,B127,B13,B131,B134,B136,B139,B14,B17,B18,B19,B21,B24,B25,B32,B33,B34,B38,B4,B40,B44,B48,B5,B51,B53,B54,B6,B63,B65,B67,B68,B7,B72,B78,B80,B83,B85,B86,B87,B90,B91,B92,B98,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C25,C27,C28,C31,C38,C39,C40,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C55,C58,C60,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C73,C76,C78,C79,C82,C84,C86,D2,D3,D5,D7
`Chr8:22513015`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A10,A16,A25,A4,B1,B101,B105,B108,B11,B110,B115,B119,B122,B128,B131,B133,B17,B19,B24,B32,B33,B44,B53,B54,B62,B67,B80,B85,B87,B9,B90,B93,B94,B98,C12,C15,C16,C19,C21,C22,C40,C45,C47,C53,C73,C74,C84,D5,D7
`Chr8:22513027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A25,B136,B91,C70
`Chr8:22513061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A8,B140,B38,B39,B79,C24,C49,C55,C71,C79,C82
`Chr8:22513114`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	148	A1,A11,A14,A18,A2,A21,A22,A24,A8,B10,B101,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B124,B125,B129,B130,B131,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B16,B2,B20,B22,B25,B26,B28,B3,B30,B32,B33,B35,B37,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B52,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B88,B89,B9,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C15,C18,C22,C23,C24,C25,C26,C29,C3,C32,C33,C36,C37,C38,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C5,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C68,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C87,C9,D1,D10,D2,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr8:22513116`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	121	A1,A11,A14,A18,A2,A21,A22,A24,A8,B10,B104,B106,B107,B109,B11,B113,B114,B117,B118,B12,B124,B125,B129,B130,B131,B135,B137,B138,B140,B16,B2,B20,B22,B26,B28,B3,B30,B33,B37,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B50,B52,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B69,B70,B71,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B88,B89,B9,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C15,C18,C22,C23,C25,C26,C29,C32,C33,C37,C38,C42,C43,C44,C46,C48,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C68,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C87,C9,D1,D2,D4,D5,D6,D9
`Chr8:22513126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr8:22513126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22513133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:22513155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A10,A20,B112,B126,B13,B49,B51,B59,B66,B75,B79,C20,C30,C34,C36,C65,D6
`Chr8:22513197`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	97	A11,A2,A24,A3,A4,A5,A8,A9,B10,B100,B103,B104,B106,B112,B114,B115,B119,B124,B129,B132,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B2,B20,B23,B25,B28,B3,B34,B36,B39,B4,B45,B47,B48,B5,B52,B54,B56,B57,B60,B61,B66,B76,B77,B78,B79,B81,B83,B9,B96,C10,C13,C15,C18,C22,C24,C26,C29,C31,C32,C33,C35,C38,C43,C44,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C64,C66,C68,C7,C70,C71,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C84,C86,D2,D4,D5,D6
`Chr8:22513204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779611.1

630 aa

315

630

RVT_3

DUF8566

DUF1985

PF13456 RVT_3 13-106 aa PF29561 DUF8566 159-336 aa PF09331 DUF1985 181-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779611.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	13	106	4.2e-09	37.1	Reverse transcriptase-like
`XP_057779611.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	159	336	1.9e-08	35.0	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057779611.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	181	315	8.6e-12	45.9	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923628.1
ATGTCGCATGCCTTCTTCTCGGATATCAATTCTATGAGGATTGGGATCGTCGTTCGTGACCATGAGGGTCACTTTGTTGCTGGTAAATCTATGCGAGTTTCGGGGCTTCGTAGGGTGGATGAAGGCGAGCTCATGGGTATCAAGGAGGTGCTTTCCTGGCTAAAGGAACTTGGTTTTTCTCGTGGTTGGGTGGAGTCCGATTGCAAGCGTGCTTGTGAGGCGATATGTTCGGGTGAGAGGAATATTTCTGAGATGGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998198
ATGTCGCATGCCTTCTTCTCGGATATCAATTCTATGAGGATTGGGATCGTCGTTCGTGACCATGAGGGTCACTTTGTTGCTGGTAAATCTATGCGAGTTTCGGGGCTTCGTAGGGTGGATGAAGGCGAGCTCATGGGTATCAAGGAGGTGCTTTCCTGGCTAAAGGAACTTGGTTTTTCTCGTGGTTGGGTGGAGTCCGATTGCAAGCGTGCTTGTGAGGCGATATGTTCGGGTGAGAGGAATATTTCTGAGATGGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779611.1
MSHAFFSDINSMRIGIVVRDHEGHFVAGKSMRVSGLRRVDEGELMGIKEVLSWLKELGFSRGWVESDCKRACEAICSGERNISEMGVLATFCREELSLLPDIHVNHFNVPYLRRDTIDQTEVAISTYYRDSHFPELVETLNVVGEQCNSDLLGRFRASCFGHFTDWRPGAKSNKALHQIVSRQIVSEENEMCFFLCGARVRFSPADYALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGTRSMTIQSLIKRVCDLDRRVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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