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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002613`

染色体: Chr08 坐标: 25482588-25483474 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002613`
名称	SmilChr08G002613
描述	probable pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25482588 - 25483474 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997251`
GeneID	`130997251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997251`
原始查询	`SmilChr08G002613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase, chloroplastic
产物	probable pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G51110` (AT5G51110) Transcriptional coactivator/pterin dehydratase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835185] identity=65.5; qcov=0.805; evalue=3.29e-73; confidence=high
Rice	`Os03g0100200` - identity=53; qcov=0.883; evalue=3.09e-60; confidence=high
GO	GO:0006729 (tetrahydrobiopterin biosynthetic process); GO:0008124 (4-alpha-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase activity); GO:0009536 (plastid)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01329 (Pterin_4a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778499.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057778499.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778499.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778499.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25482862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B88,C13,C39,C83
`Chr8:25482868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr8:25482935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B42,B43
`Chr8:25483044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B105,B12,B59
`Chr8:25483055`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B94
`Chr8:25483055`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B94
`Chr8:25483071`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B36,B78,C2,C27,C60
`Chr8:25483071`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B36,B78,C2,C27,C60
`Chr8:25483105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:25483303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778499.1

205 aa

102

205

Pterin_4a

PF01329 Pterin_4a 99-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778499.1`	Pfam	`PF01329`	Pterin_4a	Domain	99	192	2.9e-17	63.3	Pterin 4 alpha carbinolamine dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922516.1
AAAACTAATGTTATCCTTCTAGTAGCTTCCTTGAAGAAACTTCTTCCATAACCTGTGTGGTTGGAGCCACTCCACTATCCCCAAAGATAACATCAAAACAAAAAAAGCAGCTCAATCTCTTCCTCCCATGGCGCAACTCCTAGGCTTTTCTCTCTCCCCCCTCCTCTCTCTCTCTAGAATTTCAACACGCAAATGCCTCCCCTCCACCCCCAGTCCCAGACGGACTTCGCTAAGAATCCGAGCATCGGAGATCGACCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997251
ATGGCGCAACTCCTAGGCTTTTCTCTCTCCCCCCTCCTCTCTCTCTCTAGAATTTCAACACGCAAATGCCTCCCCTCCACCCCCAGTCCCAGACGGACTTCGCTAAGAATCCGAGCATCGGAGATCGACCTGCTCGGCGATTTCGGAGCCAGAGACCCTTTCCCGGCCGAGATAGAGAGCAATTTTGCCGACAAAGTTCAGGGAAACGTCAACACAGAGCACAAGATTTTGATACCGAATGCCTCCGCTCTCTCTCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778499.1
MAQLLGFSLSPLLSLSRISTRKCLPSTPSPRRTSLRIRASEIDLLGDFGARDPFPAEIESNFADKVQGNVNTEHKILIPNASALSLAQMNCAPISDLQQLSVDDAKKLLFKVVGWKLVDEGEGLKLEGLWKVRDEKCGEELINRIRDKVESTGHLPELHFEAPNQVRARLWTSSIGGLSFNDFIVAAKIDEIKVSDLQPRLRVWA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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