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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002615`

染色体: Chr08 坐标: 25490536-25493334 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002615`
名称	SmilChr08G002615
描述	metacaspase-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25490536 - 25493334 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997252`
GeneID	`130997252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997252`
原始查询	`SmilChr08G002615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metacaspase-1-like
产物	metacaspase-1-like
Arabidopsis	`AT1G02170` (MC1) metacaspase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839561] identity=71; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0565100` - identity=68.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00656 (Peptidase_C14); PF06943 (zf-LSD1); PF31181 (Pept_C14_Metacaspase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778500.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778500.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778500.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778500.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25491034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C75
`Chr8:25491050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:25491247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:25491532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B15,B41,C15,C22
`Chr8:25491588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C5
`Chr8:25491615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B68
`Chr8:25491630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B27,C21,C36
`Chr8:25492785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,B90,B92
`Chr8:25492975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr8:25493061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778500.1

359 aa

180

359

zf-LSD1

Pept_C14_Metacaspase

Peptidase_C14

PF06943 zf-LSD1 7-31 aa PF31181 Pept_C14_Metacaspase 74-223 aa PF00656 Peptidase_C14 74-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778500.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	7	31	6.1e-11	42.7	LSD1 zinc finger
`XP_057778500.1`	Pfam	`PF31181`	Pept_C14_Metacaspase	Domain	74	223	2.8e-58	197.5	Metacaspase, peptidase C14 domain
`XP_057778500.1`	Pfam	`PF00656`	Peptidase_C14	Domain	74	348	9.6e-40	137.4	Caspase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922517.1
AAATGCAAGCTATCGTATATGATTAGATTAAAAGAATTACACAAATGCACGTATCGAAGAAAAGCTTGAAAAGTTAAGCAATAGGACATTGGGAAACCTCCTCCTAAATTTCTTTATATATAATAATTTCCCTCCTTTGATCATCCTTCCACCAACTCCAATTCCTCAACCGCGCAGTTGACCTCTTCCTCTCAAGTCTCTTTCTCTCTCAAACAAAAATGTTGATGCTAGTGAACTGCTCCGGCTGCCATACGCCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997252
ATGTTGATGCTAGTGAACTGCTCCGGCTGCCATACGCCCCTCCAGCTGCCCACCGGCGCCACCTCAATCCGCTGCTCCTTGTGCCATGCCATCACCCGCATAGCTGACCCCCGCAGCGCCCCCCCTCCCCCTCCCTACGCCGCCACTTCCTCATCTTACAACAACTACTACCCACCTCCGCCGCCGGCCCCCTACAACCACTCGCCGCCCGGCGGGCAGAAGAAGGCCGTCATAATAGGGATCTCCTATCGGAACACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778500.1
MLMLVNCSGCHTPLQLPTGATSIRCSLCHAITRIADPRSAPPPPPYAATSSSYNNYYPPPPPAPYNHSPPGGQKKAVIIGISYRNTKNELKGCINDAKCMKFMLVNRFKFPESSILMLTDEETDPYRIPTKHNIRMAMFWLVKGCQSGDSLVFHFSGHGAQQRNYTGDEIDGFDETLCPLDFETQGMIVDNEINASIVRPLPAGVKLHAIIDACHSGTVLDLPFLCRMDRSGRYAWEDHRPPSGAWKGTSGGEAISFSGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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