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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002618`

染色体: Chr08 坐标: 25532847-25536965 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002618`
名称	SmilChr08G002618
描述	pectinesterase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25532847 - 25536965 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997257`
GeneID	`130997257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997257`
原始查询	`SmilChr08G002618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase 1-like
产物	pectinesterase 1-like
Arabidopsis	`AT5G61680` (AT5G61680) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836290] identity=49.9; qcov=1.03; evalue=6.3e-130; confidence=high
Rice	`Os08g0206950` - identity=39.9; qcov=0.873; evalue=1.11e-77; confidence=medium
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057778502.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057778502.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057778502.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778502.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25532980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B12,B59
`Chr8:25532999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:25533004`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B34
`Chr8:25533004`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B34
`Chr8:25533068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B81,C35,C46
`Chr8:25533266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr8:25533272`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr8:25533272`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr8:25535395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:25535593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B56,B96
`Chr8:25535786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778502.1

353 aa

176

353

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 58-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778502.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	58	342	9.2e-64	215.7	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922519.1
ATTTATTACATACCGAAATAACTGAAATGAAAATGTCGTATATTGTCGTCAAAACACTCTTGCTCTTCATTCTCAATTTCCTTCCAATAATCGCTTGCTCCAAGTTCATAATTCCGGCTGATAAATCTGAGTTGGAAAGCTGGTTCGACGCCGCCTTGAGCGATGCCTCCGCCGCCTCGAGCGCTCCGAAGGTGATCAAGGTCCGGGCCCAGGGCGGCGGCGATTTCAAGACTGTAACCGATGCCATAAACAGCATCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997257
ATGAAAATGTCGTATATTGTCGTCAAAACACTCTTGCTCTTCATTCTCAATTTCCTTCCAATAATCGCTTGCTCCAAGTTCATAATTCCGGCTGATAAATCTGAGTTGGAAAGCTGGTTCGACGCCGCCTTGAGCGATGCCTCCGCCGCCTCGAGCGCTCCGAAGGTGATCAAGGTCCGGGCCCAGGGCGGCGGCGATTTCAAGACTGTAACCGATGCCATAAACAGCATCCCCGCCGGCAACAAGGAACGCGTCGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778502.1
MKMSYIVVKTLLLFILNFLPIIACSKFIIPADKSELESWFDAALSDASAASSAPKVIKVRAQGGGDFKTVTDAINSIPAGNKERVVVSIGPGNYTEKISIPSDKPFITLQGDPNNMPFLVFNGTAAKYGTVDSATLTAEADNFYGVNLNVVNSSPRPDGMRKGAQALALRIGGDASAFYNCKFYGYQDTVFDYKGRHLFKDCYIEGTVDFIFGSGQSIYMNSEIHVIPGDPVAFITAHARSNDSETSAFVFVHCSITGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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