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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002651`

染色体: Chr08 坐标: 26000929-26005842 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002651`
名称	SmilChr08G002651
描述	8-amino-7-oxononanoate synthase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26000929 - 26005842 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997289`
GeneID	`130997289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997289`
原始查询	`SmilChr08G002651`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	8-amino-7-oxononanoate synthase
产物	8-amino-7-oxononanoate synthase
Arabidopsis	`AT5G04620` (BIOF) biotin F [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830339] identity=64.2; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0736400` (B1060H01.46-1) - identity=61; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00780 (Biotin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778538.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057778538.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778538.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778538.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26001097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C16,C53,D11
`Chr8:26001110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B15,B24,B28,B66,C23
`Chr8:26001110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B24,B28,B66,C23
`Chr8:26001182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B106,C34,C72
`Chr8:26001228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B24,B28,B66,C23
`Chr8:26001706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B24,B28,B66,C23
`Chr8:26001716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B90,B92
`Chr8:26001926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:26002763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:26002804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:26003945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B27,B74,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778538.1

469 aa

234

469

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 98-449 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778538.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	98	449	5.6e-43	148.2	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922555.1
GAGGAGAGGAGAGATTGCTGGGCCCTTGTTTTAGCTTGCACTATATATAATGTATGTCGCTGCAAAGAGCAACACCATCAACTAACGCTACTACAAGTTATATCCCAGAAGCTCCTAATTCTCGTGCAGCGCAGCAGTGTGTGTTGTGCGTGAAGAATGGAGCTAAATGGGTGGGAAATGTGGGTGGGAGAAGCCATAACCAAACTCCACTCCCTTAAAATTTTACGTTCTCTCAGACCCATTCTTCAATCCGCCTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997289
ATGGAGCTAAATGGGTGGGAAATGTGGGTGGGAGAAGCCATAACCAAACTCCACTCCCTTAAAATTTTACGTTCTCTCAGACCCATTCTTCAATCCGCCTCCATTCCCAATCCCGACGACCAATTTCGAGTTTTTGATGCTCCCAACAAATGGGACAGAGCTTCCGTTGAACTCCAAATTTCTCAATCCACATTCCATAAATGGCTGCACGACCTTCCCAGTTCAGGGGACGATAATGATGTGGTGTATGAAAATGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778538.1
MELNGWEMWVGEAITKLHSLKILRSLRPILQSASIPNPDDQFRVFDAPNKWDRASVELQISQSTFHKWLHDLPSSGDDNDVVYENVRAADEADEEFKKLIVFSGNDYLGLSSHPMVRDAATKAAQEHGMGPRGSALICGYTSYHRLLESSLASLKRKEDCLLCPTGFSANMAFMTAVGNIGRIIAGRKPSKDDRIAIFSDSLNHASIIDGVRLAEKQGNAVAFVYRHCDMCHLDELLSNCPLKKRVVVTDSLFSMDGDFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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