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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002781`

染色体: Chr08 坐标: 27504393-27508031 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002781`
名称	SmilChr08G002781
描述	uricase-2 isozyme 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27504393 - 27508031 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997402`
GeneID	`130997402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997402`
原始查询	`SmilChr08G002781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uricase-2 isozyme 1
产物	uricase-2 isozyme 1
Arabidopsis	`AT2G26230` (AT2G26230) uricase / urate oxidase / nodulin 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817163] identity=72.4; qcov=0.997; evalue=2.99e-167; confidence=high
Rice	`Os01g0865100` (P0423B08.43-2) - identity=63.7; qcov=0.993; evalue=1.35e-141; confidence=high
GO	GO:0004846 (urate oxidase activity); GO:0005777 (peroxisome); GO:0006145 (purine nucleobase catabolic process); GO:0019628 (urate catabolic process)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00232 (Caffeine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01014 (Uricase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778675.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057778675.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057778675.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057778675.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27504689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:27504707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:27507167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B17,D1
`Chr8:27507168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C31
`Chr8:27507819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:27507834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778675.1

305 aa

152

305

Uricase

PF01014 Uricase 11-135 aa PF01014 Uricase 146-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778675.1`	Pfam	`PF01014`	Uricase	Domain	11	135	2.1e-69	233.1	Uricase
`XP_057778675.1`	Pfam	`PF01014`	Uricase	Domain	146	295	2.1e-69	233.1	Uricase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922692.1
TCTACAAGTAAATTACTCTTAATAAAATAAATAATTAAAATAGAAATTAGGAAATACTACGTTTCTGAGTTCTCTTTCTTGCCACCGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCTCTTCCGTTTCACTCTCTCTCGGTCTCTCTGCAGCTGCCGGTCGCCCCCGCCTCCTCCGGCACCGCCTCGGACATCTCCGTCAAGCGCTGCGATTTGCAAGCGCCAAGCAGTCAGCACAGCAGCAGTCCGCCGCCCAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997402
ATGGCAGAAAACGGAGTGAAATTCGAGCAGCGCCACGGAAAATCTAGGGTTAGAGTCGGCAGAGTCTGGAGAGAACCGAGCGGCCGCCACCAATTCGTCGAATGGAACGTCAGCGTCAGCCTCCTCTCCGACTGCTTTCCCGCCTACACTCGCGCCGACAATTCTCACGTAGTCGCCACGGATACCATGAAAAACACGGTATATGTGAAAGCTAAAGAATGTCGGCAGCAGCTTTCAGTGGAGGACTTCGCCATACTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778675.1
MAENGVKFEQRHGKSRVRVGRVWREPSGRHQFVEWNVSVSLLSDCFPAYTRADNSHVVATDTMKNTVYVKAKECRQQLSVEDFAILLGKHFTSFYPQVSAAIINIIEKPWERIDIDGQPHDHGFKLGSEKHTAEVVVKKSGGLQVISGIEGLAVLKTTQSGFEGFVRDKYTVLPETQERMFATEVTASWKYPYETLASIPAKQLYFMEKYMDVKKVLIETFFGPTKGGVYSPSVQSTLYDMANAVLARVPDVSSIQLKMP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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