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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002877`

染色体: Chr08 坐标: 28672141-28676093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G002877`
名称	SmilChr08G002877
描述	importin subunit alpha-2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28672141 - 28676093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997485`
GeneID	`130997485`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130997485`
原始查询	`SmilChr08G002877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	importin subunit alpha-2-like
产物	importin subunit alpha-2-like
拟南芥	`AT3G06720` (IMPA-1) importin alpha isoform 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819857] identity=77.15; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os05g0155601` (Imp3) - identity=76.68; qcov=0.998; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006607 (NLS-bearing protein import into nucleus); GO:0008139 (nuclear localization sequence binding); GO:0061608 (nuclear import signal receptor activity)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00514 (Arm); PF01749 (IBB); PF02985 (HEAT); PF13513 (HEAT_EZ); PF13646 (HEAT_2); PF16186 (Arm_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997485

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亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G002877.1`
2	细胞质	1.00000	`SmilChr08G002877.1`
3	细胞质基质	1.00000	`SmilChr08G002877.1`
4	核质	0.20000	`SmilChr08G002877.1`
5	核膜	0.20000	`SmilChr08G002877.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28672309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:28672363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B79
`Chr8:28673670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:28674135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr8:28674998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:28675500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G002877.1

来源蛋白: XP_057778796.1

530 aa

265

530

IBB

Arm

HEAT_2

HEAT_EZ

Arm

HEAT

Arm

Arm_3

PF01749 IBB 12-95 aa PF00514 Arm 106-146 aa PF13646 HEAT_2 119-193 aa PF13513 HEAT_EZ 131-186 aa PF00514 Arm 149-187 aa PF02985 HEAT 161-187 aa PF00514 Arm 193-231 aa PF00514 Arm 242-272 aa PF00514 Arm 274-313 aa PF00514 Arm 317-357 aa PF00514 Arm 359-398 aa PF00514 Arm 403-441 aa PF16186 Arm_3 457-501 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF01749`	IBB	Repeat	12	95	2.5e-20	73.4	Importin beta binding domain
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	106	146	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF13646`	HEAT_2	Repeat	119	193	7.4e-22	78.2	HEAT repeats
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF13513`	HEAT_EZ	Repeat	131	186	1.2e-26	93.4	HEAT-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	149	187	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF02985`	HEAT	Repeat	161	187	7.3e-17	60.6	HEAT repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	193	231	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	242	272	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	274	313	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	317	357	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	359	398	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	403	441	3.4e-99	322.8	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`SmilChr08G002877.1` XP_057778796.1	Pfam	`PF16186`	Arm_3	Repeat	457	501	1.1e-19	70.4	Atypical Arm repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922813.1
AATACAAACCGACTTCCCACTCACTAAACCCCTGTATGTGTATAAATCCCTCGCTTCTCCACTCCGCCACTCAAAATTCAATCCCCAAATTTCATTTCGTTTTCGGTTTTCATTTTCTCGGCGATATACGTTGAATCGAACAATGTCGCTGAGGCCCAACTCTCGCGCGGATGTCCGCCGCACCAGGTACAAGGTGGCCGTTGACGCCGACGAGGGCCGCCGCCGCAGGGAGGACAACATGGTCGAGATTCGCAAGAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G002877.1 (XP_057778796.1)
ATGTCGCTGAGGCCCAACTCTCGCGCGGATGTCCGCCGCACCAGGTACAAGGTGGCCGTTGACGCCGACGAGGGCCGCCGCCGCAGGGAGGACAACATGGTCGAGATTCGCAAGAGCCGCCGCGAGGAGAACCTCCAGAAGAAGCGCCGCGAGGGCGTCCAGCAGTTCTCCGTCCCCGTCGAAGCCACGACCGGCATCGAGAAAAAGGTGCAGTTAGAAAATCTACCAGTAATGGTTCAAAGTGTTTGGACTGAAGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G002877.1 (XP_057778796.1)
MSLRPNSRADVRRTRYKVAVDADEGRRRREDNMVEIRKSRREENLQKKRREGVQQFSVPVEATTGIEKKVQLENLPVMVQSVWTEDAGQQLEATTQFRKLLSIERSPPIQEVIQAGVVPRFVQFLTREDFPQLQFEAAWALTNIASGTSEHTKVVIDHGAVPIFVKLLGSPSDDVREQAVWALGNVAGDSSTCRDLVLNYGALGPLLAQLNEHAKLSMLRNATWTLSNFCRGKPPPQFEQTSPALPVLRQLIDSTDEEVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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