当前解析结果
SmilChr08G002925| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002925 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002925 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002925 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 29316323 - 29319202 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997526 |
|---|---|
| GeneID | 130997526 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997526 |
| 原始查询 | SmilChr08G002925 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0230000; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os08g0230000; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G16840 (AT1G16840)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838255] identity=38.5; qcov=0.827; evalue=8.36e-24; confidence=medium |
| Rice | Os08g0230000- identity=40; qcov=0.754; evalue=2.11e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997526 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057778846.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778846.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778846.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778846.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778846.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:29318729 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B89,B99 |
Chr8:29318780 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr8:29318861 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C4 |
Chr8:29318861 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr8:29318889 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr8:29318983 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:29319020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B76,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。