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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003040`

染色体: Chr08 坐标: 30571018-30574044 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003040`
名称	SmilChr08G003040
描述	neutral ceramidase 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30571018 - 30574044 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997631`
GeneID	`130997631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997631`
原始查询	`SmilChr08G003040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	neutral ceramidase 2-like
产物	neutral ceramidase 2-like
Arabidopsis	`AT2G38010` (AT2G38010) Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818379] identity=61; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0624000` - identity=57.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0017040 (N-acylsphingosine amidohydrolase activity); GO:0042759 (long-chain fatty acid biosynthetic process); GO:0046512 (sphingosine biosynthetic process); GO:0046514 (ceramide catabolic process)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04734 (Ceramidase_alk); PF17048 (Ceramidse_alk_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057779000.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057779000.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779000.1`
4	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057779000.1`
5	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057779000.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30571249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B88
`Chr8:30571430`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr8:30571430`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B76
`Chr8:30571547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B2,C2
`Chr8:30571595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B107,B17,B84,C13
`Chr8:30571627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C16,C57
`Chr8:30571670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B56,B96,C39,D4
`Chr8:30571854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:30572532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B33,B88
`Chr8:30572834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C33
`Chr8:30572981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C57
`Chr8:30573015`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A18,A2,A22,B1,B100,B101,B107,B114,B118,B13,B17,B25,B27,B28,B33,B34,B46,B49,B7,B71,B74,B80,B88,C13,C15,C16,C59,C68,C73,C74,C78,C8,C80,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779000.1

746 aa

373

746

Ceramidase_alk

Ceramidse_alk_C

PF04734 Ceramidase_alk 22-576 aa PF17048 Ceramidse_alk_C 578-744 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779000.1`	Pfam	`PF04734`	Ceramidase_alk	Domain	22	576	6.3e-217	721.9	Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, N-terminal
`XP_057779000.1`	Pfam	`PF17048`	Ceramidse_alk_C	Domain	578	744	7.5e-42	143.7	Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923017.1
ATGTACAATCGCGAAGCTCTAAGTCTAGCCATCATCACCTGCTTCGTAGTTGCTAATGCAGACTACTTAATAGGGGTGGGGAGCCACGATATGACCGGCCCGGCAGCCGGAGTCAATATGATGGGTTATGCTAACATGGAGCAGGTCACCGGAGGCATACATTTCCGGCTCCGGGCACGGGCCTTCGTCGTCGCTGAGACCGACCAAGTTGGTGCTCGAATCGCCTTTGTTAACCTCGATGCTGGGATGGCCTCCCAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997631
ATGTACAATCGCGAAGCTCTAAGTCTAGCCATCATCACCTGCTTCGTAGTTGCTAATGCAGACTACTTAATAGGGGTGGGGAGCCACGATATGACCGGCCCGGCAGCCGGAGTCAATATGATGGGTTATGCTAACATGGAGCAGGTCACCGGAGGCATACATTTCCGGCTCCGGGCACGGGCCTTCGTCGTCGCTGAGACCGACCAAGTTGGTGCTCGAATCGCCTTTGTTAACCTCGATGCTGGGATGGCCTCCCAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779000.1
MYNREALSLAIITCFVVANADYLIGVGSHDMTGPAAGVNMMGYANMEQVTGGIHFRLRARAFVVAETDQVGARIAFVNLDAGMASQLVTIKVLERLKSRYGELYSEENVAISGTHTHAGPGGYLQYVTYSVTSLGFVPQSFDVLVTAIELSIVQAHESLKPGSILINTGDVEKGGINRSPSAYLLNPPDERDRYPSNVDTQMTLLKLVDKSSGKSRGAFSWFATHGTSMSKDNKLISGDNKGAAARFFEDWFASTNTNAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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