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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003045`

染色体: Chr08 坐标: 30607312-30611631 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003045`
名称	SmilChr08G003045
描述	serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30607312 - 30611631 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997654`
GeneID	`130997654`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997654`
原始查询	`SmilChr08G003045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like
产物	serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like
Arabidopsis	`AT3G53500` (RS2Z32) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824518] identity=56.3; qcov=1.02; evalue=2.37e-88; confidence=high
Rice	`Os05g0120100` - identity=84.6; qcov=0.502; evalue=2.2e-92; confidence=medium
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016607 (nuclear speck)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997654

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779034.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057779034.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057779034.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779034.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30608181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:30608251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,D11
`Chr8:30610407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C74
`Chr8:30610587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:30611140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C1
`Chr8:30611215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B101,B25
`Chr8:30611308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C16
`Chr8:30611315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:30611317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C16
`Chr8:30611338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779034.1

311 aa

156

311

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 14-75 aa PF00098 zf-CCHC 104-119 aa PF00098 zf-CCHC 125-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779034.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	75	1.9e-14	54.0	RNA recognition motif
`XP_057779034.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	104	119	5.2e-11	42.8	Zinc knuckle
`XP_057779034.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	125	141	5.2e-11	42.8	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923051.1
ACACAAACCCACCAACCATGATTTCTGCACCCTCCGATTCAACCATCAAATCTTAGCCGTTTAAATAAGTCGGTTATTCACTATAAAAGGACGTCGAGATCTCGTCTGTTCCCCTTTTACGCTGTCCTTAAAAATTAGGGTTGCAGTTTCAAGTTCGGAATTTTGAATTACAAGCTGTACAATGCCACGTTACGAGGACAGATATGGGAGCACTACTCGCCTCTATGTTGGTCACTTGTCCTCACGGACCCGATCTCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997654
ATGCCACGTTACGAGGACAGATATGGGAGCACTACTCGCCTCTATGTTGGTCACTTGTCCTCACGGACCCGATCTCGCGATCTTGAGCATGTGTTTAGTAGATATGGCAGAGTACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTACGCCTTTGTTGAATTCAGTGATCCACGTGATGCTGATGATGCTAGATATAACCTGGATGGTCGAGATGTGGATGGACGCCGCATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGTGTGCCACGTGGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779034.1
MPRYEDRYGSTTRLYVGHLSSRTRSRDLEHVFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYNLDGRDVDGRRIIVEFAKGVPRGPGGVREYVGRGPAPGSGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIERNCQNSPKKLSSGRGRSYSRSPVRSRSPRRGGRSRSRSFSRSRSYSRSRSPAARRGRDADYKERRSRSPRGESPDLKRDASPTKSRKLSPTPDRDAPRERSASPSRGRVETEQDGYNSDSPKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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