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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003096`

染色体: Chr08 坐标: 31144636-31148411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003096`
名称	SmilChr08G003096
描述	lipid phosphate phosphatase gamma
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31144636 - 31148411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997667`
GeneID	`130997667`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997667`
原始查询	`SmilChr08G003096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lipid phosphate phosphatase gamma
产物	lipid phosphate phosphatase gamma
Arabidopsis	`AT5G03080` (LPPgamma) Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831801] identity=71; qcov=1.01; evalue=4.89e-110; confidence=high
Rice	`Os03g0288700` - identity=65.6; qcov=0.959; evalue=8.69e-100; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006487 (protein N-linked glycosylation); GO:0008610 (lipid biosynthetic process); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0047874 (dolichyldiphosphatase activity)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01569 (PAP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997667

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057779059.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057779059.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057779059.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779059.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31145011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:31145176`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr8:31145176`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr8:31145211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:31145451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:31145487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:31145532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779059.1

221 aa

110

221

PAP2

PF01569 PAP2 53-174 aa

XP_057779060.1

221 aa

110

221

PAP2

PF01569 PAP2 53-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779059.1`	Pfam	`PF01569`	PAP2	Family	53	174	4e-20	72.6	PAP2 superfamily
`XP_057779060.1`	Pfam	`PF01569`	PAP2	Family	53	174	4e-20	72.6	PAP2 superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923077.1
ATGAAAAAGTTATTGGTAATAAAAATATTTCAAATACAATAAAGATATTTATCCCAACGAGAATTTGAACATAAGATAAAAAAAAAGTAGTACTAAAACCGTAATGTATCCTAAAATAGTTGATTGCAAATTTACTACTACTATGTTCCTTCCCTCCTCATCAGATCACACAACTCATAATCGAATACGAGTTGTCTACAATCAAACATTCTTCTCTCTCTAGAATTGGGCAAAGATCTGCTCCTCTTTTTCCCAGTTTC...

XM_057923076.1
ATCCCAACGAGAATTTGAACATAAGATAAAAAAAAAGTAGTACTAAAACCGTAATGTATCCTAAAATAGTTGATTGCAAATTTACTACTACTATGTTCCTTCCCTCCTCATCAGATCACACAACTCATAATCGAATACGAGTTGTCTACAATCAAACATTCTTCTCTCTCTAGAATTGGGCAAAGATCTGCTCCTCTTTTTCCCAGTTTCCATGACGAATTCCCTCAAGGCCGTAACCCTAACTCACGTCCGGTACCAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997667
ATGACGAATTCCCTCAAGGCCGTAACCCTAACTCACGTCCGGTACCAGAGGGGCGATCAGCTGGGCCATTTCCTGGCATGGATTTCCCTGGTCCCCGTCTTCATCAGCTTCGGCGGCTTCGTCTCCCACTTCATCTTCCGCCGCGAGCTCCAGGGCATGTTCTTCGCCATCGGCCTCCTCATCTCCCAAGTCGTCAACGAAGTCATCAAGACCTCCGTCCAGCAGGCCCGCCCCGAGACCTGCGCGCTGCTCGAGATGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779059.1
MTNSLKAVTLTHVRYQRGDQLGHFLAWISLVPVFISFGGFVSHFIFRRELQGMFFAIGLLISQVVNEVIKTSVQQARPETCALLEMCDSHGWPSSHSQYMFFFAVYFTLLTHYRIGALFRNQMAMVLLVVWPMAVLTMYSRVYLGYHTVAQVFAGAALGIALGGGWFWVVNNWFRCHFPAMEESVVGRLLYLKDTSHIANVLKFEYENTRAARKEACKRSD

XP_057779060.1
MTNSLKAVTLTHVRYQRGDQLGHFLAWISLVPVFISFGGFVSHFIFRRELQGMFFAIGLLISQVVNEVIKTSVQQARPETCALLEMCDSHGWPSSHSQYMFFFAVYFTLLTHYRIGALFRNQMAMVLLVVWPMAVLTMYSRVYLGYHTVAQVFAGAALGIALGGGWFWVVNNWFRCHFPAMEESVVGRLLYLKDTSHIANVLKFEYENTRAARKEACKRSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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