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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003240`

染色体: Chr08 坐标: 33303080-33305564 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G003240`
名称	SmilChr08G003240
描述	S-adenosylmethionine synthase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33303080 - 33305564 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997815`
GeneID	`130997815`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130997815`
原始查询	`SmilChr08G003240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-adenosylmethionine synthase 3-like
产物	S-adenosylmethionine synthase 3-like
拟南芥	`AT2G36880` (MAT3) methionine adenosyltransferase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818260] identity=93.33; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os05g0135700` (OsSAMS1) - identity=89.92; qcov=0.992; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0004478 (methionine adenosyltransferase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006556 (S-adenosylmethionine biosynthetic process)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00670 (One carbon pool by folate - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00999 (Biosynthesis of various plant secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00438 (S-AdoMet_synt_N); PF02772 (S-AdoMet_synt_M); PF02773 (S-AdoMet_synt_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997815

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	1.00000	`XP_057779234.1`
2	细胞质基质	1.00000	`XP_057779234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33304323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:33304668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,B84,C43
`Chr8:33304860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:33304989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B66,C12,C13,C6
`Chr8:33305070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B131,C32,C68,D7
`Chr8:33305087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:33305206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779234.1

390 aa

195

390

S-AdoMet_synt_N

S-AdoMet_synt_M

S-AdoMet_synt_C

PF00438 S-AdoMet_synt_N 4-101 aa PF02772 S-AdoMet_synt_M 117-238 aa PF02773 S-AdoMet_synt_C 240-381 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057779234.1`	Pfam	`PF00438`	S-AdoMet_synt_N	Domain	4	101	9.7e-44	148.7	S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal domain
`XP_057779234.1`	Pfam	`PF02772`	S-AdoMet_synt_M	Domain	117	238	5.5e-48	162.8	S-adenosylmethionine synthetase, central domain
`XP_057779234.1`	Pfam	`PF02773`	S-AdoMet_synt_C	Domain	240	381	2.3e-61	206.4	S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923251.1
AACCGCTATGGCGCATGGTACAATTTGCGGAATGCAGAAAACTGTGGTAATCACAACCCAAGTGAGCCGACACCGTCAATGGGGCCAGCTGGCACCGTCTCACTGGCTAACTGGCACCATAGGAGTCCGGTAGTGGGCCCGGGTAGGGTAGGTTTTTTTGATTTGCCAAGGGAAACTAGAGAGCGAGTCCTTCGGATCCGGGTTTATAAATACCCGCGCCTTCATTTCAACTAACCTGCATCTCACTACGCTACTTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057779234.1_44483
ATGGATACCTTCCTGTTCACCTCAGAGTCTGTCAATGAAGGACACCCCGACAAGCTCTGCGACCAAGTCTCAGATGCCATTCTTGATGCTTGCCTAGAGCAGGACCCAGAGAGCAAAGTAGCATGTGAAACTTGCACCAAGACTAATATGGTCATGGTCTTTGGTGAGATCACAACCAAGGCTAAGGTGGACTATGAAAAGATAGTTCGTGATACCTGCAGAGGGATTGGATTCACCTCGCCAGATGTTGGCCTTGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779234.1
MDTFLFTSESVNEGHPDKLCDQVSDAILDACLEQDPESKVACETCTKTNMVMVFGEITTKAKVDYEKIVRDTCRGIGFTSPDVGLDADHCKVLVNIEQQSPDIAQGVHGHLTKKPEEIGAGDQGHMFGYATDETPELMPLTHVLATKLGAKLTEVRKNKTCAWLRPDGKTQVTVEYKNEGGAMVPIRVHTVLISTQHDETVTNDQIAADLKEHVIKPVIPAQYLDDKTIFHLNPSGRFVIGGPHGDAGLTGRKIIIDTYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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