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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003304`

染色体: Chr08 坐标: 34195180-34198400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003304`
名称	SmilChr08G003304
描述	nuclear-pore anchor-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34195180 - 34198400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997865`
GeneID	`130997865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997865`
原始查询	`SmilChr08G003304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear-pore anchor-like
产物	nuclear-pore anchor-like
Arabidopsis	`AT1G22060` (AT1G22060) sporulation-specific protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838811] identity=42.4; qcov=0.205; evalue=2.64e-24; confidence=weak
Rice	`Os03g0107400` - identity=38.6; qcov=0.827; evalue=2.78e-75; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10358 (NT-C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057779277.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057779277.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779277.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779277.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34195869`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A4,B104,C83
`Chr8:34195869`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A4,B104,C83
`Chr8:34196142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:34196160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:34196168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr8:34196203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:34196579`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A10,B140,B44,B57,B8,B81,C41,C47,C53,C56,C66,C68
`Chr8:34196620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:34196675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:34196730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:34196787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:34196861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779277.1

578 aa

289

578

NT-C2

PF10358 NT-C2 14-144 aa

XP_057779278.1

577 aa

288

577

NT-C2

PF10358 NT-C2 14-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779277.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	14	144	4e-13	49.9	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins
`XP_057779278.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	14	144	4e-13	49.9	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923295.1
ATAAATGAAATAATAGTCCTAGTATTCTCGCATTTGATTGAGGCAAGTGGTGTTTAACTTTTAGTGAATTTTGGTTGAAGCATGGAAGTTGGAAGTTGAGTGGTGAAGAAACAATGGCATATATGAGCACGTGAAATCCAAAGGATGAACTACTCACTATTCATTTCTAACATACATATAGGTTGAGAACAATGACTAGCCAGCTAACTGCATTGTTTCTATCACTACAACACTACCAATCCTCACTTTACAAGATATCT...

XM_057923294.1
ATTGAGGCAAGTGGTGTTTAACTTTTAGTGAATTTTGGTTGAAGCATGGAAGTTGGAAGTTGAGTGGTGAAGAAACAATGGCATATATGAGCACGTGAAATCCAAAGGATGAACTACTCACTATTCATTTCTAACATACATATAGGTTGAGAACAATGACTAGCCAGCTAACTGCATTGTTTCTATCACTACAACACTACCAATCCTCACTTTACAAGATATCTTCAATGCACTGTAGCCCACAGTGAGACACAATGTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997865
ATGTTGAAGATGCAGAGGCCAACCAACAGATCATCATCCAAACAAATTAGACACAGATTTGATTTCAAGTTCTCCAGTTTTCAAGCACTTCAGGTGCCAAAGGGATGGGACAGGCTTTTTGTGTCTCTGGTTTCTGCAGAAACTGGGAAGACAATAGCCAAATTGGGGAAGGCACTTGTTAAGAATGGCAGTTGCCTCTGGTCCGAGACAGTATCCGAATCTATCTACATTTTGAGATATGATTCTTCTAAATCCTACGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779277.1
MLKMQRPTNRSSSKQIRHRFDFKFSSFQALQVPKGWDRLFVSLVSAETGKTIAKLGKALVKNGSCLWSETVSESIYILRYDSSKSYEECLVKFVVSTGSTRSANTLGEAIINMAQHTSSRASAAVSQPLKKCSYGTIFQVKIQRVNLPRSRIRDEESKNSDSQEKVEDVDHFGAGSKSRRSDNSSEDPATSSRPLQLDTEQEASESATVVINSISSMEGSYERENSFVEKDSRSDEYRSHERRGRGSYGGGLLPEFYSVD...

XP_057779278.1
MLKMQRPTNRSSSKQIRHRFDFKFSSFQALQVPKGWDRLFVSLVSAETGKTIAKLGKALVKNGSCLWSETVSESIYILRYDSSKSYEECLVKFVVSTGSTRSANTLGEAIINMAQHTSSRASAAVSQPLKKCSYGTIFQVKIQRVNLPRSRIRDEESKNSDSQEKVEDVDHFGAGSKSRRSDNSSEDPATSSRPLQLDTEEASESATVVINSISSMEGSYERENSFVEKDSRSDEYRSHERRGRGSYGGGLLPEFYSVDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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