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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004044`

染色体: Chr08 坐标: 48916201-48925595 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004044`
名称	SmilChr08G004044
描述	long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48916201 - 48925595 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996924`
GeneID	`130996924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996924`
原始查询	`SmilChr08G004044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal-like
产物	long chain acyl-CoA synthetase 6%2C peroxisomal-like
Arabidopsis	`AT5G27600` (LACS7) long-chain acyl-CoA synthetase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832820] identity=74.6; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0143900` (LACS7) - identity=74.6; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004467 (long-chain fatty acid-CoA ligase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006631 (fatty acid metabolic process); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057778183.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057778183.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778183.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778183.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778183.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48916538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B104,D2
`Chr8:48916614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B51,B52,C10
`Chr8:48918850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C62
`Chr8:48920669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B104,D2
`Chr8:48921887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:48922409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B101,D5
`Chr8:48922788`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr8:48922788`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr8:48922804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B101,C8,D5,D7
`Chr8:48925171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:48925205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778183.1

697 aa

348

697

AMP-binding

PF00501 AMP-binding 108-507 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778183.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	108	507	2.5e-90	303.8	AMP-binding enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922200.1
AAACATGGGAGTTTGAATATTTATTTTGGAAAAAATTTGGTTTCTTCTCAAGAAATAACGACCCTTATCCTACACCCTACCTGCAATTTATCTTCCAACTTGGCACCACCTCTTTGAATAGCGTGCCCACGTTACCAAATTCAATACTCCTATTTTATACTCTTCCGTATTCATATCATCATATATCTATATATTACATCACTTTTGATTCAATTCTACCGCTTCCCACATCTTCTTTTGTCGTTGCTTATTGCATACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996924
ATGGAGTCCATAGCTGAACGGCGGCTGAGATTGATTCAGACCCATCTGATTCCCGACGCCGATCATTCGTCGTTTTCGATTTCCGCCAACCCCACCGCCGGTGAATTCTTCCAAGACCAGAAGTATAGTGTAGTTCTTCCTGAGAGACTGCAAACGGGGAAATGGAATGTGTACAGATCCGCCCGTTCTCCATTGAAGCTTGTTGATAGATTCCCTGATCATCCAGATATTGGCACATTGCATGATATTTTTGTACACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778183.1
MESIAERRLRLIQTHLIPDADHSSFSISANPTAGEFFQDQKYSVVLPERLQTGKWNVYRSARSPLKLVDRFPDHPDIGTLHDIFVHSVESFQDYKYLGTRIRIDGTVGDYKWMTYGEAGTARSAIGSGLHHHGLQPGACVGLYFINRPEWMIVDHACSAFSYISVPLYDTLGPDAVKYIVNHADIQAIFCVPSTLNTLLSFLSEIPSVRVIVVVGGVDEHLPSLPSGSGVKLVSYTRLLSQGRSNMHPFCPPRPEDVATI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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