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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004080`

染色体: Chr08 坐标: 49428622-49429979 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004080`
名称	SmilChr08G004080
描述	NADPH-dependent aldehyde reductase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49428622 - 49429979 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998602`
GeneID	`130998602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998602`
原始查询	`SmilChr08G004080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADPH-dependent aldehyde reductase 1, chloroplastic-like
产物	NADPH-dependent aldehyde reductase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G54870` (AT1G54870) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841926] identity=74.9; qcov=0.857; evalue=4.17e-164; confidence=high
Rice	`Os05g0140800` - identity=69; qcov=0.866; evalue=1.62e-140; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2); PF23441 (SDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057779999.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057779999.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779999.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779999.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49428823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:49428830`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A10,A15,A22,A3,A4,A5,A7,B10,B101,B115,B118,B120,B135,B137,B140,B15,B18,B2,B20,B24,B25,B36,B38,B39,B59,B66,B81,B86,B89,B91,C1,C18,C27,C35,C44,C54,C55,C57,C58,C64,C65,C66,C70,C75,C82,C86,C9,D5
`Chr8:49429039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C80
`Chr8:49429174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:49429325`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C12
`Chr8:49429325`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C12
`Chr8:49429329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:49429446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:49429655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr8:49429949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779999.1

335 aa

168

335

SDR

adh_short

adh_short_C2

PF23441 SDR 79-284 aa PF00106 adh_short 85-279 aa PF08659 KR 87-263 aa PF13561 adh_short_C2 93-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779999.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	79	284	5.6e-12	46.3	SDR-like rossmann domain
`XP_057779999.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	85	279	6.7e-45	153.7	short chain dehydrogenase
`XP_057779999.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	87	263	8.8e-07	29.7	KR domain
`XP_057779999.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	93	327	1.6e-53	182.4	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924016.1
ACGAAGGGTTCCAAGAGAAAAATATCGGTGGCGCGCCATCTAAATCTGATGTATTCTCCCCTTACGTGGCACTCTGCCGACGTGTCAACTCTACACGTATCCCTCTCTCTCACTTCTCCCCTGCCACGTTCTCCTCTCCTCCAAATTCCTATTTCTACCGCCACCTCCTCCTCCTCCGCCGCTCTCCACTCCATAAATTATGCTCTTTTCCCCCATCTCGTCTCCTTCCCAAATCCACACTCGCAATCTCCTCCACCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998602
ATGCTCTTTTCCCCCATCTCGTCTCCTTCCCAAATCCACACTCGCAATCTCCTCCACCGCCACGTCACTTTCAAATCTCACTCATCACCAATCACTCCACTCCCCAAGTTTCTGCAGATCCGATCAATGGCTTCCGGCGACAAACAATTCCCACCGCAGAGACAGGATGCTCAGCCAGGAAAAGAGCACCTCATGGACCCCACTCCCCGCGCCGCCACCGCAGACTACAAGCCAGCTGACAAGCTCGTCGGCAAGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779999.1
MLFSPISSPSQIHTRNLLHRHVTFKSHSSPITPLPKFLQIRSMASGDKQFPPQRQDAQPGKEHLMDPTPRAATADYKPADKLVGKVALVTGGDSGIGRAVAHCFALEGATVAFTYVKGQEDKDASDTLSMLSGAKHRDAKDPVAIPTDLGYDDNCRRVVDEVVNSFGRIDILVNNAAEQYEAGSVEEIDEPRLDRVFRTNIYSYFFTTRHALKHMKEGSSIINTTSVNAYKGNAKLLDYTATKGAIVAFTRGLALQLAQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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