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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004128`

染色体: Chr08 坐标: 50154739-50159753 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004128`
名称	SmilChr08G004128
描述	zeta-carotene desaturase, chloroplastic/chromoplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50154739 - 50159753 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998879`
GeneID	`130998879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998879`
原始查询	`SmilChr08G004128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zeta-carotene desaturase, chloroplastic/chromoplastic
产物	zeta-carotene desaturase%2C chloroplastic/chromoplastic
Arabidopsis	`AT3G04870` (ZDS) zeta-carotene desaturase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819647] identity=82.58; qcov=0.958; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os07g0204900` - identity=83.9; qcov=0.918; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0016117 (carotenoid biosynthetic process); GO:0016719 (9,9'-di-cis-zeta-carotene desaturase activity)
KEGG	smil00906 (Carotenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01593 (Amino_oxidase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998879

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780285.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057780285.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057780285.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057780285.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057780285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50154992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:50155504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr8:50155765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B76,C2,D5
`Chr8:50155792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C69
`Chr8:50156590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr8:50156951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr8:50158325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:50158373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C34,C49
`Chr8:50159034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:50159601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B68,C30,D10
`Chr8:50159640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C24,C26,C29,C30,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780285.1

575 aa

288

575

NAD_binding_8

Amino_oxidase

PF13450 NAD_binding_8 75-140 aa PF01593 Amino_oxidase 80-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780285.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	75	140	3.6e-14	53.5	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057780285.1`	Pfam	`PF01593`	Amino_oxidase	Domain	80	544	1.9e-72	245.7	Flavin containing amine oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924302.1
AATAAAAACACACACACAGAGAGGTCAAAATTCGGTTTGGAATCCAGACAAATTCCACCATCAGCATCTTCTTCTCTTTAGATACCCCCAATAAATAAGCCGCTGCCTAATCCCCTTCACCCTTCCCTCCTCTCTTTCTTTATCAATTCTCATTTGTGAGAATTGAACTTCAAACTGGGGCAGCAGGAGAGGAAGAAGAAAGAGTTGGTGCATGGCTGCCTCTGCTGCTGCTTCCGCTTCTCTTTGCTTTCCGGCAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780285.1_45319
ATGGCTGCCTCTGCTGCTGCTTCCGCTTCTCTTTGCTTTCCGGCAAATGGGAACCGCTCCGATTTCCGTATCGGGTCTTCTTCTAAGCAGCTCAAGAGATTTCGTAGGGCCACAATCCGCTCCGATTTGGACTCCAATGTCTCCGACATGAGCACTAATGCTCCAAAAGGTTTATTTCCACCGGAACCTGAGCATTACCGCGGCCCGAAGCTAAAAGTGGCAATCATCGGAGCTGGGCTTGCTGGCATGTCGACTGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780285.1
MAASAAASASLCFPANGNRSDFRIGSSSKQLKRFRRATIRSDLDSNVSDMSTNAPKGLFPPEPEHYRGPKLKVAIIGAGLAGMSTAVELLDQGHEVDIYDSRSFIGGKVGSFVDKKGNHIEMGLHVFFGCYNNLFRLLKKVGAEKNLLVKDHTHTFVNKGGEIGELDFRFPVGAPLHGINAFLTTNQLEPYDKARNAVALALSPVVRALVDPDGAMRNIRDLDNISFSDWFMSKGGTRKSIQRMWDPVAYALGFIDCDNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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