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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004163`

染色体: Chr08 坐标: 50935375-50936910 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004163`
名称	SmilChr08G004163
描述	serine/threonine-protein kinase-like protein At5g23170
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50935375 - 50936910 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998900`
GeneID	`130998900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998900`
原始查询	`SmilChr08G004163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase-like protein At5g23170
产物	serine/threonine-protein kinase-like protein At5g23170
Arabidopsis	`AT5G23170` (AT5G23170) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832381] identity=44.5; qcov=0.847; evalue=8.1e-75; confidence=medium
Rice	`Os05g0387700` (OsRLCK186) - identity=42.7; qcov=0.875; evalue=1.3e-67; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780318.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780318.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780318.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780318.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50935631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr8:50935634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:50935661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:50935667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B121,C80,D3
`Chr8:50935744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr8:50935756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:50935759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:50935811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:50935836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:50935858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B95,C20
`Chr8:50935862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B112,B122,B14,B93,C13,C22,C38,C4
`Chr8:50935873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780318.1

353 aa

176

353

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 19-280 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 20-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780318.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	19	280	2.9e-32	112.8	Protein kinase domain
`XP_057780318.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	20	282	4.4e-30	105.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924335.1
TAAGAAAAGCAGCTACTCATTACCTTAAAAAAATATTTACAACAATACAAAAAAAATTGGGTATCCCCAAAAACTCCTCATTTCTTCACAAAAGGCAAAGAAGAAAAAGCTAAAGGAAAATGGGGCCTCAAAAGAACAGCTAATAGAGCAATATTCTGACTTCGTCAGCCCACCTTTGCCTTTTCTCGAAATACCCTTTCGCTTTTCTATTAATTATTCCCATTAAATAAACTAAAGATTTTGATTCCCTCTCTCTCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998900
ATGTACGAGTTTGAAGCGCAAGAAATCGAAGACGCCACGGACGGCTTCTCGCCGTCGCGGCTGATCGGAAAAGGCAGCCACGGCAGCGTATACAGCGGCGTCCTCAAAGACGGCCGCGTCGTCGCCGTGAAGAAGCAATCCCTCGCCCTCGAGAACCTCCGCGACGACACCAAGCTCCGAAACGAGGCCCTCATCCTCTCCTCCATCCCTCCAAATCCATGCACCGTCGCCTTCGTCGGCGCCGCCGCCGGCAACGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780318.1
MYEFEAQEIEDATDGFSPSRLIGKGSHGSVYSGVLKDGRVVAVKKQSLALENLRDDTKLRNEALILSSIPPNPCTVAFVGAAAGNVIVTDYMPNGTLHHLLHLSDAPPPWPTRLRIALQLASALRRLHDSNPSIVHRDVKSANILFDGDWNARLADFGLAARLCDGDDVASKLPAGTLGYIDPGYTAPGMLTVKIDVFSYGVVLLELVAARRVIDVTRSPASLVEWAVPLIERGRGLEICDKRIRMPLYTRRAITKLLGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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