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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004195`

染色体: Chr08 坐标: 51339429-51343302 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004195`
名称	SmilChr08G004195
描述	common plant regulatory factor 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51339429 - 51343302 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998929`
GeneID	`130998929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998929`
原始查询	`SmilChr08G004195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	common plant regulatory factor 1-like
产物	common plant regulatory factor 1-like
Arabidopsis	`AT2G46270` (GBF3) G-box binding factor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819235] identity=50.7; qcov=1.05; evalue=8.69e-118; confidence=high
Rice	`Os05g0569300` (OsbZIP45) - identity=40.7; qcov=1.03; evalue=2.18e-83; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2); PF07777 (MFMR); PF16596 (MFMR_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780345.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780345.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780345.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780345.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780345.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51340786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B88,C20
`Chr8:51340807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C82
`Chr8:51340888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:51341474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:51342017`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B140,B2,B78,B88,C81
`Chr8:51342017`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B140,B2,B78,B88,C81
`Chr8:51342214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B83,C29,C41,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780345.1

401 aa

200

401

MFMR

MFMR_assoc

bZIP_1

bZIP_2

PF07777 MFMR 1-93 aa PF16596 MFMR_assoc 114-188 aa PF00170 bZIP_1 256-318 aa PF07716 bZIP_2 258-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780345.1`	Pfam	`PF07777`	MFMR	Family	1	93	5.2e-31	107.8	G-box binding protein MFMR
`XP_057780345.1`	Pfam	`PF16596`	MFMR_assoc	Disordered	114	188	2.1e-08	35.4	Disordered region downstream of MFMR
`XP_057780345.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	256	318	8.6e-21	74.5	bZIP transcription factor
`XP_057780345.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	258	307	2.5e-09	37.8	Basic region leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924362.1
TGCTACAGTTGGAGGTTGGATGGGAGCATTGATACTTGTCATCTTGTTCGACCATCATTAAGCAGAGCATCAAGAGTTGTTCCCGAACACATCATGGGAAACAGTGAAGAAGGGAAGGCTACCAAGTTGGAAAAATCATCTTCACCTGCGGTGGATCAGAATAACATGCATATGTATCCTGACTGGGCAGCAATGCAGGCTTACTATGGTCCCCGATTTGCTGTTCCACCATATATGAATTCGGCTGTTACTTCCCCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998929
ATGGGAAACAGTGAAGAAGGGAAGGCTACCAAGTTGGAAAAATCATCTTCACCTGCGGTGGATCAGAATAACATGCATATGTATCCTGACTGGGCAGCAATGCAGGCTTACTATGGTCCCCGATTTGCTGTTCCACCATATATGAATTCGGCTGTTACTTCCCCGCATGCACCACCCTCCTATATGTGGGGTCCACCACAGTCGATGATCCCTCCTTATGGAGCTCCATATGCTGCCTTCTATGCTCATGGAGGAGTTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780345.1
MGNSEEGKATKLEKSSSPAVDQNNMHMYPDWAAMQAYYGPRFAVPPYMNSAVTSPHAPPSYMWGPPQSMIPPYGAPYAAFYAHGGVYAHPGVPMAGTAMNVETPAKSSGNTDGGFVKKLKEFDGLAISIGNGNGDGTENETDRRLSTDSDETDGSSDGSNGVAQGANQNGKKRNGQGSPEREDGKAPKKSSLAPLVEVGRASEKMMDVIPPANKPVKAMENMNTAVEIKEPSLSAISSPTSVPLPSIPNESWMQNERELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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