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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004408`

染色体: Chr08 坐标: 53757596-53759025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004408`
名称	SmilChr08G004408
描述	transcription factor MYB17-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53757596 - 53759025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999132`
GeneID	`130999132`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999132`
原始查询	`SmilChr08G004408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB17-like
产物	transcription factor MYB17-like
Arabidopsis	`AT3G61250` (MYB17) myb domain protein 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825297] identity=62.2; qcov=1.01; evalue=1.1e-122; confidence=high
Rice	`Os02g0641900` (myb7) - identity=48.5; qcov=1.02; evalue=1.25e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999132

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780613.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780613.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780613.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780613.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53757737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:53757778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:53757861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:53757870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C63,C67
`Chr8:53757891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D7
`Chr8:53757903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C73,C8,D11
`Chr8:53757918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:53757926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr8:53757945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C18,C30
`Chr8:53758080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C63,C67
`Chr8:53758100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B85,C9
`Chr8:53758101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780613.1

296 aa

148

296

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-75 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-112 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780613.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	1.2e-35	122.1	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057780613.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	75	2.1e-19	70.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057780613.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	112	1.2e-35	122.1	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057780613.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	114	2.1e-19	70.2	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924630.1
TGATACTGTTATGCTTCTGACTTGATGGATCCAAATTTCTCTCTGTGTGTGTGAAGTCTCTGTCCATATATATATATATATATATATATACATATATGAAATAGTAGTGGTGTCAGAAATAAATGAAAGGAGGTCATGAAAAGAGCAATAAATAAAATATTCCATTGAAAATCAATCATTCAATATCCTCGTCCTTGTTGTTGAACAACATTTGCATCATTTATAGATTAGCAAAGATGAGAATCCTCTCAAAATAGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999132
ATGGGCAGAGCTCCATGCTGTGAGAAGAAGGGTTTGAAGAAGGGGCCTTGGACTCCTGAGGAAGATGACAAGCTGGTTGACTACATTGACAAGCATGGCCATGGCAGCTGGAGATCCCTCCCCAAGCTTGCAGGTCTTCTCCGTTGCGGGAAGAGCTGCCGTCTGCGCTGGACGAATTATCTTCGTCCAGACATAAAACGGGGCCCGTTTACGGGCGACGAGGAGAAGCTCGTGATCCAGCTCCACGCCGTCCTCGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780613.1
MGRAPCCEKKGLKKGPWTPEEDDKLVDYIDKHGHGSWRSLPKLAGLLRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGPFTGDEEKLVIQLHAVLGNRWAAIASQLPGRTDNEIKNLWNTHLKKRLLLMGIDPGTHEPSPSSALVSRPPSAPSTRHMAQWEGARLEAEARLSRESLLCFPPAAPGSEEGGGDHFLRLWNSEVGETFRRMNIKNQPRSPSSSASTRCRSFSGTTTEVELKAADALAKSTSSNETEDSSESTLQLLLDLPNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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