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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004516`

染色体: Chr08 坐标: 54773681-54777133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004516`
名称	SmilChr08G004516
描述	uncharacterized SmilChr08G004516
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54773681 - 54777133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998696`
GeneID	`130998696`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130998696`
原始查询	`SmilChr08G004516`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
拟南芥	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=27.55; qcov=0.639; evalue=3.85e-61; confidence=low
水稻	`Os01g0595300` - identity=29.18; qcov=0.639; evalue=1.45e-74; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998696

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G004516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54775873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C54
`Chr8:54775934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:54775936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:54776073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr8:54776952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B36,B67,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004516.1

来源蛋白: XP_057780090.1

854 aa

427

854

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 470-563 aa PF00872 Transposase_mut 487-638 aa PF04434 SWIM 711-743 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004516.1` XP_057780090.1	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	470	563	2.8e-19	70.0	MULE transposase domain
`SmilChr08G004516.1` XP_057780090.1	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	487	638	7.3e-08	32.4	Transposase, Mutator family
`SmilChr08G004516.1` XP_057780090.1	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	711	743	5.4e-06	26.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924107.1
TCTGGCGGATACTTGGTCTGTTAGGCAGAAAATAATATTTTATGTCAAATTATGTATAATTTTTAATTTTTCAGCTTGTTATGAATGTTTAAATATAACATACGCATTCCCCTTTTGTATTTGTTGCGATTTTTTACTTTTAATTTTTTAGTAAAAAATTAAAAGTACATACTGAGAAGGTGACTCTGCAAAAAATTTGGTTGTAGTGGGGCATTAATGCTAATTTTATGCATGCGTGAGGTGACATGCAATAATAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004516.1 (XP_057780090.1)
ATGGAATTCGTGAGATACATATATGTGAGATACAACGGAGTCGTCGATGGTATACACTATGTTGGCGGGGCTACGGAGGTCCTTCCCCTCTTAAATGAAACAGTTGCGAGCCTGATATACAGCATCAACAATGTGCTGACAATGCATTCGTTGAGCCCGAACTATCAATTGTATTATTTGGCGACCAATCGATTTGGAAGGGAGACGAAATGCGTAATAAGTGACGACGATGATGTGCAAGGCTTGTTGGAAACTGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004516.1 (XP_057780090.1)
MEFVRYIYVRYNGVVDGIHYVGGATEVLPLLNETVASLIYSINNVLTMHSLSPNYQLYYLATNRFGRETKCVISDDDDVQGLLETAEYPMVYVEHNNDPVEEAYIPTFDFGQASGYGDDEAQSSQYETSYHARESAPPTQYFSWDGQLLDESAWNLNEMCGRFNQVRTDDDSDEEAVQPEDEAEEPDDDSDEEDEEYDPTNESGTDSAASEDLLDDDLIEFTATERAGWIRQSRTRHGNPTDSTGELSNWIVPLIPVDAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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