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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004619`

染色体: Chr08 坐标: 55737466-55738998 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004619`
名称	SmilChr08G004619
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55737466 - 55738998 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998746`
GeneID	`130998746`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130998746`
原始查询	`SmilChr08G004619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
拟南芥	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=38.26; qcov=0.653; evalue=2.89e-64; confidence=medium
水稻	`Os11g0633500` - identity=31.74; qcov=0.849; evalue=1.33e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998746

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞膜	1.00000	`SmilChr08G004619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55737547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:55737551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:55737607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:55737667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:55737822`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B10
`Chr8:55737822`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B10
`Chr8:55737826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:55738053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C55
`Chr8:55738067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B2,C43,C67,C87
`Chr8:55738177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:55738192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C67,C87
`Chr8:55738202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004619.1

来源蛋白: XP_057780138.1

510 aa

255

510

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 151-316 aa PF23559 WHD_DRP 400-471 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004619.1` XP_057780138.1	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	151	316	2.7e-43	148.3	NB-ARC domain
`SmilChr08G004619.1` XP_057780138.1	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	400	471	3.1e-21	75.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924155.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATTATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAATTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCCTTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTCATAACCAACACTAATATTGATGGAGGTAGCAAACAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCACACATTTTCGATCAAATTCATGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004619.1 (XP_057780138.1)
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATTATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAATTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCCTTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTCATAACCAACACTAATATTGATGGAGGTAGCAAACAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCACACATTTTCGATCAAATTCATGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004619.1 (XP_057780138.1)
MAAYAALVSVMNIIEQMMSHPRLSIVFDKKQIESLGEKADGLLDFITNTNIDGGSKQASDLESQIASAAHAAEDVIESHIFDQIHAGSSHGCSLLDLQQIIEEMDGIMRKGAELKEKWRAREEQAAHGDVDVVEEKQPLTTTGKASPVGLEDDVIHIMDKLTIHQSKQLIISIVGMGGTGKTTLALNVYENSLIQRHFDIRAWATVSQQYSAHEIFSKLLSSIGQSGSGNDLGVKLHQTLCGRRYLIVLDDIWSVEAWDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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