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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004832`

染色体: Chr08 坐标: 57584538-57586921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004832`
名称	SmilChr08G004832
描述	chloroplast envelope quinone oxidoreductase homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57584538 - 57586921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998817`
GeneID	`130998817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998817`
原始查询	`SmilChr08G004832`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplast envelope quinone oxidoreductase homolog
产物	chloroplast envelope quinone oxidoreductase homolog
Arabidopsis	`AT4G13010` (AT4G13010) Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826914] identity=66.7; qcov=0.847; evalue=2.33e-59; confidence=high
Rice	`Os09g0503100` - identity=50.7; qcov=0.847; evalue=2.85e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13602 (ADH_zinc_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057780207.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780207.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780207.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057780207.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57586294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr8:57586305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B19,B6,C27
`Chr8:57586321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:57586324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C48
`Chr8:57586395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:57586398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B112,B35,B61,C72
`Chr8:57586456`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr8:57586456`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr8:57586459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B92
`Chr8:57586462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B92
`Chr8:57586481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:57586498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,B74,B91,D10,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780207.1

177 aa

177

ADH_zinc_N_2

PF13602 ADH_zinc_N_2 66-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780207.1`	Pfam	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	Domain	66	175	9.3e-15	56.4	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924224.1
ATGAGCCCTGATCAAGAAGCCCATTTGGGAGAAGAGCGCTCGCTTAGAAGCCCTAGCTTCTCACTTGAGCCCGCACTCGGTTTCCAGAGTCATAGCAGCCCACAGCGGAGATATCCCACTCTGCCTCACTTTTCTCACGTGACAGCCACCAACATTGGCCTAGTGAAGAGCCTCGGAGCGGAGGGAGCCGCTCTCACGAGCCCCTCGGGCAAGAAGTACGACGCGGTGGTTCACTGCGCACCGCCCATCCCTTGGTCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998817
ATGAGCCCTGATCAAGAAGCCCATTTGGGAGAAGAGCGCTCGCTTAGAAGCCCTAGCTTCTCACTTGAGCCCGCACTCGGTTTCCAGAGTCATAGCAGCCCACAGCGGAGATATCCCACTCTGCCTCACTTTTCTCACGTGACAGCCACCAACATTGGCCTAGTGAAGAGCCTCGGAGCGGAGGGAGCCGCTCTCACGAGCCCCTCGGGCAAGAAGTACGACGCGGTGGTTCACTGCGCACCGCCCATCCCTTGGTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780207.1
MSPDQEAHLGEERSLRSPSFSLEPALGFQSHSSPQRRYPTLPHFSHVTATNIGLVKSLGAEGAALTSPSGKKYDAVVHCAPPIPWSVFEPNLSSNGKVIDVSSMLTFAVKKLTFSKKQLVPIVLLIPKGESLQYLVDLVRQGKLQTVIDSRTPLSKAGDAWTKSIDGHATGKIVIEP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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