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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004939`

染色体: Chr08 坐标: 58282552-58286690 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004939`
名称	SmilChr08G004939
描述	ruBisCO large subunit-binding protein subunit beta, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58282552 - 58286690 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999592`
GeneID	`130999592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999592`
原始查询	`SmilChr08G004939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ruBisCO large subunit-binding protein subunit beta, chloroplastic
产物	ruBisCO large subunit-binding protein subunit beta%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G13470` (Cpn60beta2) TCP-1/cpn60 chaperonin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820549] identity=85.86; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os06g0114000` (OsCPn60beta1) - identity=83.06; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0022626 (cytosolic ribosome); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051085 (GO:0051085); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999592

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781148.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057781148.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057781148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58282998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:58283039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B83
`Chr8:58283078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:58283412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:58283587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B63,C5,C85,C87
`Chr8:58283932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C32,C68
`Chr8:58283942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:58284023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:58284329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B104,B73,C87,D1
`Chr8:58284332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B104,B73,C87,D1
`Chr8:58284335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:58284585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781148.1

608 aa

304

608

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 86-588 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781148.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	86	588	6.5e-84	283.1	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925165.1
TAGTTGGATGCTCGAGAAATTTCTGTGGGAGAGGTTCTAGATTGTTCCTTTCCGCTACAGAGGCGCAATCCGACGGCTGAGATGAAGTGGAAACTTCAAGAAGTGAGCTAACCCCTTGATTTCCACACACTACACACACTCACCTACTTGTACTAAAAACCTACTCGACCAATCTACGACTTGCATCTGCTTCTGGATAAACCCTCTTTCTCATCCGCTGCGTCTTCTAACACTTTCATTCTTCAATCTCCCTTCAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999592
ATGGCGTCAACTTTTTCTGGCCTGTCCTCAGTCGGTTCATTGGCTGCCCCGGGCAGCAGGGTGCTTGATGATAAAATCGCAGTTTCATCGAGCAGGTTGTCGTCTCTTGCTTCTATATCCTCTAGTTCGCTTGGGAGGAGAAAGAACGTGGTCCTCAGCAAAACACGCCCTTCTCAGATAACAGCTGCTGCCAAGGACTTGTACTTCAACAAGGATGGCTCAGCCATCAAGAGACTTCAGGTTGGTGTTAACAAACTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781148.1
MASTFSGLSSVGSLAAPGSRVLDDKIAVSSSRLSSLASISSSSLGRRKNVVLSKTRPSQITAAAKDLYFNKDGSAIKRLQVGVNKLADLVGVTLGPKGRNVVLESKYGAPKIVNDGVTVAREVELEDPVENIGAKLVRQAAAKTNDLAGDGTTTSVVLAQGLIAEGVKVVAAGANPVLITRGIEKTTKALVAELKAISKEVEDSELADVAAVSAGNNYEVGNMIAEALSKVGRKGVVTLEEGRSAENNLYVVEGMQFDRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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