基因组区间工具
按丹参标准染色体区间提取序列、查看区间内基因，并生成基础 PCR 引物候选。推荐使用 Chr01-Chr08。
区间信息
| 标准染色体 | Chr01 |
|---|
| SeqID | NC_080387.1 |
|---|
| 坐标 | 47739-50415 |
|---|
| 长度 | 2677 bp |
|---|
| GC% | 36.87 |
|---|
序列预览
GAtgcacatttttttatttttgttagcgGAGCAAGCAGCTGCAGCCCAtttgatttcttcttcttttctctattttcattttcccccaaattcagcagcagcagcggcaaaTCTTGTTCTTATCTCTGAGAGTTAATTCGGTTATAATTGAGTTATTGGTAAATAAATGGTACTCTTGCACGCCGCCAGGAGAGGTGCTGCTTTTGTTGCCGGCCGCCGCTTGCACAACCGCACCTCTTCATTTTTCGCTTGTTCATGTACAGTGAGTTCTCTTTTGCTAATGTTCTTGATGTTGCCCGTGTTTTCCAGTTTTTTTATGTGTTCCTTTTTTATTTCAGCTTTAGGATTGGAAAAGTTTTAAGTAAGCCATTTGCATCTAATCTTGCATTCATAAAAATTGATTGTTGGATGCTGAACTATTTGTAATGACGATTATGTTGGTTTTTGCATGAAATtagcagaagaagaaaaaaaacaaaaacgaaaAGATATTGGTGGTTTTATTGGTTATTTGTAGTTGTAAGCATTGCCATTAGAAGTATGTTTTATGTAGTAATGAAATTAGCAGAAAAGGAGAAAGTTAAGTGATGGTTTATTGGCTATTTGTACTTGTAATTACTTCCATAAGAAGTATGCGTTATGTTATCCAatattcaaattgtattataaatttataatggtGAAATTGTTGCTTGCTAGGATTTTTTCATCTTTCCGATTAAGTGTTAAAAGTATATTGTGTTGGACTCAGCTGAGAATGTTATATCTTTCATAGAATGTGAAGCATAATGTTTTTTTGTTACATTTTCCAACTAAATGGAAAGAGAAGTAAACCGGATATTTTTCTCGTTCCTCCCTCAACACAACATTTGAAATGATCCCTAATTCAGTACCATTTGGTCATTTCTGTCCCCTTCCTAGACTACTAACATTTGTACAGAGTAGGCAGCGTTGATCCTACTCGAAACCTAGAAATTTGGTTCGAGATTCTGGTTATTTT...
区间内基因
| 基因 |
坐标 |
链 |
描述 |
SmilChr01G000001 |
Chr01:47739-50415 |
+ |
transcription termination factor MTERF9, chloroplastic-like |
PCR 引物候选
这是用于快速筛选的基础候选引物；正式实验前建议再用专业引物软件复核特异性、二聚体和发卡结构。
该区间长度或序列组成不适合自动给出基础引物候选。