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丹参结构域预测

输入丹参 Gene ID、Transcript ID 或 Protein ID，查看 Pfam 预测功能结构域、蛋白 N 端到 C 端示意图，以及结构域所在氨基酸起始和终止位置。
示例

Pfam 结构域结果已接入网站。

基因信息

统一新 Gene IDSmilChr01G000001
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标47739 - 50415
链方向+
描述transcription termination factor MTERF9, chloroplastic-like

基因查询显示该基因的所有蛋白异构体；RefSeq 蛋白 ID 查询仅显示对应蛋白序列。

3 条蛋白序列 6 个 Pfam 结构域

结构域示意图

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr01G000001.1
来源登录号XP_057790285.1
406 aa
N
1
203
406
mTERF
mTERF
C
PF02536 mTERF 91-164 aa PF02536 mTERF 153-363 aa
SmilChr01G000001.2
来源登录号XP_057790286.1
362 aa
N
1
181
362
mTERF
mTERF
C
PF02536 mTERF 47-120 aa PF02536 mTERF 109-319 aa
SmilChr01G000001.3
来源登录号XP_057790287.1
334 aa
N
1
167
334
mTERF
mTERF
C
PF02536 mTERF 19-92 aa PF02536 mTERF 81-291 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr01G000001.1 Pfam PF02536 mTERF Family 91 164 4.6e-38 131.6 mTERF
SmilChr01G000001.1 Pfam PF02536 mTERF Family 153 363 4.6e-38 131.6 mTERF
SmilChr01G000001.2 Pfam PF02536 mTERF Family 47 120 3e-38 132.2 mTERF
SmilChr01G000001.2 Pfam PF02536 mTERF Family 109 319 3e-38 132.2 mTERF
SmilChr01G000001.3 Pfam PF02536 mTERF Family 19 92 2.1e-38 132.7 mTERF
SmilChr01G000001.3 Pfam PF02536 mTERF Family 81 291 2.1e-38 132.7 mTERF