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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000189`

染色体: Chr01 坐标: 3239067-3240349 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000189`
名称	SmilChr01G000189
描述	uncharacterized SmilChr01G000189
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3239067 - 3240349 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984912`
GeneID	`130984912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984912`
原始查询	`LOC130984912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=low
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=30.9; qcov=0.354; evalue=6.68e-12; confidence=low
Rice	`Os12g0292200` - identity=38.6; qcov=0.229; evalue=9.43e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763963.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057763963.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057763963.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763963.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3239072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B106
`Chr1:3239169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B105,B107,B29,B47,B87,B92,C55
`Chr1:3239179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:3239213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:3239299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A13,A14,A16,A22,A7,A8,B100,B103,B108,B111,B112,B122,B128,B129,B13,B131,B136,B16,B17,B18,B2,B27,B31,B48,B5,B52,B60,B63,B7,B73,B76,B8,B81,B84,B97,C1,C11,C36,C4,C43,C49,C59,C69,C9,D1,D2,D6,D9
`Chr1:3239334`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A18,A20,A21,B104,B108,B124,B125,B133,B134,B21,B26,B30,B33,B4,B53,B54,B77,B84,B95,C11,C12,C15,C17,C19,C2,C20,C37,C42,C47,C56,C57,C6,C60,C65,C8,D2,D3,D4
`Chr1:3239337`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A18,A20,A21,A6,B104,B108,B124,B125,B133,B134,B21,B26,B30,B33,B4,B53,B54,B59,B77,B84,B95,C11,C12,C15,C17,C19,C2,C20,C37,C42,C47,C56,C57,C6,C60,C65,C8,D2,D3,D4
`Chr1:3239359`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A18,A2,A20,A21,A23,A24,A6,B102,B104,B108,B124,B125,B131,B133,B134,B21,B26,B30,B32,B33,B34,B4,B46,B53,B54,B59,B70,B77,B79,B84,B95,C11,C12,C15,C17,C19,C2,C20,C36,C37,C42,C46,C47,C53,C56,C57,C6,C60,C65,C69,C73,C8,D10,D2,D3,D4
`Chr1:3239370`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A18,A2,A20,A21,A23,A24,A6,B102,B104,B108,B124,B125,B131,B133,B134,B21,B23,B26,B30,B33,B34,B4,B46,B53,B54,B59,B70,B77,B84,C12,C17,C19,C2,C20,C37,C39,C42,C45,C46,C47,C56,C57,C6,C60,C65,C69,C73,C8,D10,D2,D3,D4
`Chr1:3239381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C37,C51,C53
`Chr1:3239396`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr1:3239396`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907980.1
ATGAAGATGTTCGAGATCCAAATTGGGCAAATAGGCACTGCCATCAGCAATCTGCACCAGTCAGGAAAATTTCCAAGCAATACCAAGGTGAACCCGAATGAGCAGTGCATGGCTATTGGGTTGAAAAGTGCAGCCACATCTGAAGGCAACCATGGATCTCGTGAGATGGGGGATGAGTCAAAGCAAAACCACGAGGGGAGTCGACGAGTCCCACCTCCATATCATCCCCCCTGGTATCCCATGTCGTTTCCCCAACGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984912
ATGAAGATGTTCGAGATCCAAATTGGGCAAATAGGCACTGCCATCAGCAATCTGCACCAGTCAGGAAAATTTCCAAGCAATACCAAGGTGAACCCGAATGAGCAGTGCATGGCTATTGGGTTGAAAAGTGCAGCCACATCTGAAGGCAACCATGGATCTCGTGAGATGGGGGATGAGTCAAAGCAAAACCACGAGGGGAGTCGACGAGTCCCACCTCCATATCATCCCCCCTGGTATCCCATGTCGTTTCCCCAACGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763963.1
MKMFEIQIGQIGTAISNLHQSGKFPSNTKVNPNEQCMAIGLKSAATSEGNHGSREMGDESKQNHEGSRRVPPPYHPPWYPMSFPQRHYKIVDLPSGTTQEWPKMPEDESAPPVVEEKDEEVTVERHQKERMKERLSKFLEIFKKVNINIPLVEMSQEMLQYAKFLKDIVSRKKKLGEFETEKLNEECSAILQRKLPAKIKDPGSFTISCIIGGQHFGRSLCDLGASINLMSLSVFQQLAIGELKPTSMRLQMADSSVTYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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