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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G000150

染色体: Chr05 坐标: 1220281-1220818 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G000150
名称SmilChr05G000150
描述zinc finger CCCH domain-containing protein 30-like
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向1220281 - 1220818 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130984931
GeneID130984931
locus_tag-
NCBI NameLOC130984931
原始查询LOC130984931

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述zinc finger CCCH domain-containing protein 30-like
产物zinc finger CCCH domain-containing protein 30-like
ArabidopsisAT1G19860 (AT1G19860)
Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838574]
identity=44.3; qcov=0.952; evalue=2.9e-16; confidence=low
RiceOs04g0663200 (OsC3H30)
-
identity=51; qcov=0.59; evalue=2.94e-13; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130984931

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057763626.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057763626.1
3 Nucleoplasm 核质 0.20000 XP_057763626.1
4 Cytosol 细胞质基质 0.20000 XP_057763626.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057763626.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057907643.1
GCAAATCCTCCTTCAGAAGTAGGAATGGCGTCGCGATCGGGTGGTTATGAAGCTGATGAGAGCTTGCCACCAGGCTTTGAAGATATGAAGCCTAAAATTCTCAAGTTGCCTCAGAAAGCTTTCCCCAAATGGAGATGCCCTCCAAGATTTGAAGTGAATAGGGAGTGGCAAGTGGTCTCTGGGGAAGAGAGCAAAGAGATTGAGTGTGAGAATCAATGCGAGAGGAGAGTGCTCGAAGCAATTTATCCCCAGCCCTCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130984931
ATGGCGTCGCGATCGGGTGGTTATGAAGCTGATGAGAGCTTGCCACCAGGCTTTGAAGATATGAAGCCTAAAATTCTCAAGTTGCCTCAGAAAGCTTTCCCCAAATGGAGATGCCCTCCAAGATTTGAAGTGAATAGGGAGTGGCAAGTGGTCTCTGGGGAAGAGAGCAAAGAGATTGAGTGTGAGAATCAATGCGAGAGGAGAGTGCTCGAAGCAATTTATCCCCAGCCCTCAGCAATTCCTCCCAAGTAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057763626.1
MASRSGGYEADESLPPGFEDMKPKILKLPQKAFPKWRCPPRFEVNREWQVVSGEESKEIECENQCERRVLEAIYPQPSAIPPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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