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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000256`

染色体: Chr05 坐标: 1949622-1961220 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000256`
名称	SmilChr05G000256
描述	probable helicase MAGATAMA 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1949622 - 1961220 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984967`
GeneID	`130984967`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984967`
原始查询	`LOC130984967`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable helicase MAGATAMA 3
产物	probable helicase MAGATAMA 3
Arabidopsis	`AT4G15570` (MAA3) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827233] identity=62.1; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0440200` - identity=59.9; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004386 (helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13086 (AAA_11); PF13087 (AAA_12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984967

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763653.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057763653.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763653.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763653.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763653.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1950700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B94,C12,C37
`Chr5:1950764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B55
`Chr5:1950780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:1950784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:1953946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr5:1953966`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr5:1953966`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr5:1953986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr5:1953987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:1953992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr5:1954120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:1954669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B11,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763653.1

861 aa

430

861

AAA_11

AAA_12

PF13086 AAA_11 245-427 aa PF13086 AAA_11 439-518 aa PF13087 AAA_12 526-722 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763653.1`	Pfam	`PF13086`	AAA_11	Domain	245	427	6.1e-59	200.6	AAA domain
`XP_057763653.1`	Pfam	`PF13086`	AAA_11	Domain	439	518	6.1e-59	200.6	AAA domain
`XP_057763653.1`	Pfam	`PF13087`	AAA_12	Domain	526	722	6.2e-63	212.6	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088839.1
GGGTGAAACCTTAAACCCTACAATCAGCAACTTAACTTCAAACTTTAAACCCTCCTCTCACTGCCAACCGTCCAAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGCTGAATTTCGAGCGGGGAAGTTATGGCGGTCGACAAGCACAAGCTCGAGAAAGAAGCGTGCGTTCTTCGATTTTACAAAATAGTGCTCAGTTGGGACTACAATCGCATATTGGACGAAGCAGAGAAGCGGCAACGTCAACCGAGACGTGCTCAGGGATTGAA...

XM_057907670.1
GGGTGAAACCTTAAACCCTACAATCAGCAACTTAACTTCAAACTTTAAACCCTCCTCTCACTGCCAACCGTCCAAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGCTGAATTTCGAGCGGGGAAGTTATGGCGGTCGACAAGCACAAGCTCGAGAAAGAAGCGTGCGTTCTTCGATTTTACAAAATAGTGCTCAGTTGGGACTACAATCGCATATTGGACGAAGCAGAGAAGCGGCAACGTCAACCGAGACGTGCTCAGGGATTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984967
ATGGCGGTCGACAAGCACAAGCTCGAGAAAGAAGCGTGCGTTCTTCGATTTTACAAAATAGTGCTCAGTTGGGACTACAATCGCATATTGGACGAAGCAGAGAAGCGGCAACGTCAACCGAGACGTGCTCAGGGATTGAAAGAGGTTAAGAACACGTATGCAGATGTTGATGAATATCTTGGGACATTTGAGCCGCTGCTATTTGAAGAAGTTAAAGCAAATATTGCTCAAAAAAAAGATGAAGACGAAGAAAGAGTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763653.1
MAVDKHKLEKEACVLRFYKIVLSWDYNRILDEAEKRQRQPRRAQGLKEVKNTYADVDEYLGTFEPLLFEEVKANIAQKKDEDEERVCQEAMVAECREVNEFHLPMVICSDPEKVSENDLLLVSNKKFEGKIPSAYAFALVEHRQQDKLRLRLYLGGEVKRYNTDEIQSRPRLLNMLPVVCEVKKMFFLEKICSLSTIVREYVALQSISYLPFKDLILNAAEIDNVTEDRAWKLSKPLKEFIESNHNKSQLEAIYAGLSRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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