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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000252`

染色体: Chr05 坐标: 1917650-1925590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000252`
名称	SmilChr05G000252
描述	probable helicase MAGATAMA 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1917650 - 1925590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984970`
GeneID	`130984970`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984970`
原始查询	`LOC130984970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable helicase MAGATAMA 3
产物	probable helicase MAGATAMA 3
Arabidopsis	`AT4G15570` (MAA3) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827233] identity=62.4; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0424200` - identity=60.2; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004386 (helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13086 (AAA_11); PF13087 (AAA_12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984970

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763657.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763657.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057763657.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763657.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763657.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1917870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B82,B85
`Chr5:1917871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,C28,C53,C6
`Chr5:1917982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:1917994`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr5:1917994`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr5:1918024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr5:1918054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B85
`Chr5:1919096`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C3,D10
`Chr5:1919096`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C3,D10
`Chr5:1919186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:1919197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B63,B89,C21,C51
`Chr5:1919243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C45,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763657.1

831 aa

416

831

AAA_11

AAA_12

PF13086 AAA_11 257-438 aa PF13086 AAA_11 451-530 aa PF13087 AAA_12 538-734 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763657.1`	Pfam	`PF13086`	AAA_11	Domain	257	438	4.4e-59	201.0	AAA domain
`XP_057763657.1`	Pfam	`PF13086`	AAA_11	Domain	451	530	4.4e-59	201.0	AAA domain
`XP_057763657.1`	Pfam	`PF13087`	AAA_12	Domain	538	734	3.5e-63	213.4	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907674.1
ACGAAGAACAGCTGCAAAAATTTCTCTAATGACATATTCTTGAGAGATGGTAGCCCAAGCACAAATATCAAAACGCTCCTTAATAAGACGATCTTCATAAACAGTTCTAGCAAGAGTGGTCTTACCAGAGCCGCCCATCCCTACAATGGGAATGATTTGTAGATGAAGGCGATCAGAAGTGAGCTTATCCATCAGTTGAAGCTTGAGATCATCAGCACCCACCATGCTACTCTGCTGCGGAATCGAAGTGGGAATGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984970
ATGCTACTCTGCTGCGGAATCGAAGTGGGAATGATCTCACGTATCCTAAGTACTGGATGGGGGACAATACTCATTAGCATATTGGACAATCAAATAGTGCTCAGTTGGGACTACAATCGCATATTGGACGAAGCAGAGAAGCGGCAACGTCAACCGAGACGTGCTCAGGGATTGAAAGAGGTTAAGAACACGTATGCAGATGTTGATGAATATCTTGGGACATTTGAGCCGCTGCTATTTGAAGAAGTTAAAGCAAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763657.1
MLLCCGIEVGMISRILSTGWGTILISILDNQIVLSWDYNRILDEAEKRQRQPRRAQGLKEVKNTYADVDEYLGTFEPLLFEEVKANIAQKKDEDEERVCQEAMVAECREVNEFHLPMVICSDPEKVSENDLLLVSNKKFEGKIPSAYAFALVEHRQQDKLRLRLYLGGEVKRYNTDEIQSRPRLLNMLPVVCEVKKMFFLEKICSLSTIVREYVALQSISYLPFKDLILNAAEIDNVTEDRAWKLSKPLKEFIESNHNKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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