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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000262`

染色体: Chr05 坐标: 2000847-2002934 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000262`
名称	SmilChr05G000262
描述	ammonium transporter 2 member 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2000847 - 2002934 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984984`
GeneID	`130984984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984984`
原始查询	`LOC130984984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ammonium transporter 2 member 4-like
产物	ammonium transporter 2 member 4-like
Arabidopsis	`AT2G38290` (AMT2) ammonium transporter 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818409] identity=53.1; qcov=1.02; evalue=1.67e-162; confidence=high
Rice	`Os01g0870300` (OsAMT3) - identity=56.6; qcov=0.957; evalue=5.8e-168; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008519 (ammonium channel activity); GO:0072488 (ammonium transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00909 (Ammonium_transp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057763685.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763685.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763685.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763685.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763685.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2001033`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr5:2001033`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr5:2001081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:2001193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:2001210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr5:2001232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr5:2001243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr5:2001245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A2,B38,B39,C8
`Chr5:2001257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr5:2001258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C19
`Chr5:2001260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C19
`Chr5:2001267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B91,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763685.1

467 aa

234

467

Ammonium_transp

PF00909 Ammonium_transp 16-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763685.1`	Pfam	`PF00909`	Ammonium_transp	Family	16	427	1.2e-80	271.9	Ammonium Transporter Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907702.1
CTCTCTCATCAATGGCCGACGAGTCGAGCCCCGACTGGCTGAACAAAGGCGACAACGCGTGGCAGCTGACGGCGGCCACCCTGGTGGCGCTGCAATCGATGCCGGGGCTGGTCATCCTCTACGGCGGCTTCTCGAAGCACAAGTGGGCCGTGAACTCCTCCGTCATGGCGGTCTACGCCTTCGCCGCCACCCTCATCTGCTGGGTCGGCTGGGGCTACCGCATGTCCTTCGGCGACAAGCTGCTCGACTTCGTCGGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984984
ATGGCCGACGAGTCGAGCCCCGACTGGCTGAACAAAGGCGACAACGCGTGGCAGCTGACGGCGGCCACCCTGGTGGCGCTGCAATCGATGCCGGGGCTGGTCATCCTCTACGGCGGCTTCTCGAAGCACAAGTGGGCCGTGAACTCCTCCGTCATGGCGGTCTACGCCTTCGCCGCCACCCTCATCTGCTGGGTCGGCTGGGGCTACCGCATGTCCTTCGGCGACAAGCTGCTCGACTTCGTCGGGAGGCCGGGGCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763685.1
MADESSPDWLNKGDNAWQLTAATLVALQSMPGLVILYGGFSKHKWAVNSSVMAVYAFAATLICWVGWGYRMSFGDKLLDFVGRPGPALDENFLLGRAFLGGFPTATMVWFQFVFAAIAPVLVAGALLGRMNFAAWMAFVPLWHTLSYTVGAYSVWNPEGWLAKMGVIDFAGGFVIHLSSGVAGFTAAYWVGPRSDSDRKRFPPNNIVMMLGGAGLLWMGWTGFNGGAPYAASAVASLAVINTHVCAAVSLVTWLVLDFSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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