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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000266`

染色体: Chr05 坐标: 2013377-2019498 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000266`
名称	SmilChr05G000266
描述	serine/threonine-protein kinase Nek2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2013377 - 2019498 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984987`
GeneID	`130984987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984987`
原始查询	`LOC130984987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase Nek2
产物	serine/threonine-protein kinase Nek2
Arabidopsis	`AT3G04810` (NEK2) NIMA-related kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819641] identity=59.3; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0604700` (OsNek2) - identity=59.2; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057763688.1`
2	Centrosome	中心体	0.80000	`XP_057763688.1`
3	Spindle	Spindle	0.80000	`XP_057763688.1`
4	Spindle pole	Spindle pole	0.80000	`XP_057763688.1`
5	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057763688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2013601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D10
`Chr5:2013652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:2013799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2013821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:2013904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:2014063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C42
`Chr5:2014160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:2014587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr5:2014725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B106,B55,C15,C52
`Chr5:2014840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:2014867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr5:2014950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763688.1

627 aa

314

627

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 4-257 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 6-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763688.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	4	257	7.2e-63	213.2	Protein kinase domain
`XP_057763688.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	6	254	2.3e-38	132.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907705.1
AAGTAATCTCTCTCTCTCCATTTTGTCTGCTTCTGCATCACTATTAAACTTGTCGCTTTTGATAATATTATATTCTCTCTACATTGTGTGTTGTGTGTGTTGTTGGGAGCAGAAAACAGTGAACAGTGGTGATGCACTCTGAATCTGTGATGGAGGAAGGAAGAAGGAAACCACCTGCTTAATTCCTGCGCATATATCGCCACCATTGCAGCGCCGTCGCTTTAACTGTAGCTGATGTCAGAGTACTAGCTTCCTGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984987
ATGGACAAGTATGAAGTACTGGAACAGATCGGCAAGGGCGCTTTTGGTTCTGCACTTCTTGTGAGGCATAAGCAGGAAAAGAAGAAGTATGTGTTAAAGAAGATTCGTCTTGCCCGCCAAACCAACAGGACACGGCGGTCTGCACATCAGGAGATGGCACTTATATCCAGCATGCAAAATCCATTTATAGTGGAGTACAAAGATTCATGGGTGGAGAAGGGTTGCTATGTTTGCATTGTCATAGGTTACTGTGAAGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763688.1
MDKYEVLEQIGKGAFGSALLVRHKQEKKKYVLKKIRLARQTNRTRRSAHQEMALISSMQNPFIVEYKDSWVEKGCYVCIVIGYCEGGDMAEAIKKANGVHLPEEKLCRWLVQLLIALDYLHMSHILHRDVKCSNIFLTKDQDIRLGDFGLAKMLSSDELASSIVGTPSYMCPELLADIPYGSKSDVWSLGCCMYEMTSLKPAFKAFDMQALINKINKSIVAPLPAKYSGAFRGLVKSMLRKNPELRPSAAELLRHQHLQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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