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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000267`

染色体: Chr05 坐标: 2030783-2033065 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000267`
名称	SmilChr05G000267
描述	trihelix transcription factor GTL2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2030783 - 2033065 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984990`
GeneID	`130984990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984990`
原始查询	`LOC130984990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor GTL2
产物	trihelix transcription factor GTL2
Arabidopsis	`AT5G28300` (AT5G28300) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832914] identity=33.8; qcov=1.32; evalue=9.64e-80; confidence=low
Rice	`Os02g0648300` - identity=41.6; qcov=0.553; evalue=2.09e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13837 (Myb_DNA-bind_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763691.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763691.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763691.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763691.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057763691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2030971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B121,B72,C37,D9
`Chr5:2030971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B72,C37,D9
`Chr5:2030993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B121,B88,C15,D3
`Chr5:2031020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B56,B85,B96
`Chr5:2031036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B126,C58,D6
`Chr5:2031130`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A23,B107,B65,C37,C87
`Chr5:2031130`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A23,B107,B65,C37,C87
`Chr5:2031132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,B65,C24
`Chr5:2031140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A15,A16,B106,B118,B38,B39,B70,C1,C13,C33,C4,C71
`Chr5:2031150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,D3
`Chr5:2031162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,C48
`Chr5:2031219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763691.1

421 aa

210

421

Myb_DNA-bind_4

PF13837 Myb_DNA-bind_4 64-125 aa PF13837 Myb_DNA-bind_4 315-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763691.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	64	125	2.9e-30	105.2	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057763691.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	315	401	2.9e-30	105.2	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907708.1
CATGCCCACCTAGCTATTTACTACTCTCCTGCAATACAAGACAAAGTTGGGTGATGAATAAGAGAGAGAGAGAGATAAGAGTTTAGAGAGAGAGAGAGTGTGTAGGTTTTGTTTAATCCCTTCCTCCCTTCCTCAGTTAAGAAGGCGATCGAGGGGTGAGAATGTTCGATGGGAGCGAGCAGTTCCACCAATTCATAGCTTCGTCGAGAGCTTCACTACCCATCTCTCTTCCCTTCCCCACTCTCCCCTCCTTCGACCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984990
ATGTTCGATGGGAGCGAGCAGTTCCACCAATTCATAGCTTCGTCGAGAGCTTCACTACCCATCTCTCTTCCCTTCCCCACTCTCCCCTCCTTCGACCCCTACGCGCCGCCGCTGCACCACCCTTCCTCCGCCAAGAAGTACCCCTTAATCTCCACCAATCTCGCCCTCGAGAGCGACCCCTCCACCGCCGATCCATGGTCCCACGACGAGCTCCTCGCGCTGCTCAAACTCAGATCCACCATGGAGATTTGGTTCCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763691.1
MFDGSEQFHQFIASSRASLPISLPFPTLPSFDPYAPPLHHPSSAKKYPLISTNLALESDPSTADPWSHDELLALLKLRSTMEIWFPDFTWEHVSRKLGELGFKRSGEECKEKFEEESCRHFAASKSYRILSELDEFYPQVPARQGQEDEAETSKNDEDVVILRNPEAEAAAEEAEEKGDKSRSKRKRRDKLEATFKGFCEAVVSKMMAKQEELHRRLMDDVVRREEEKIAREEAWRGREAERARRELEARSKEQKTAAER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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