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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000270`

染色体: Chr05 坐标: 2081917-2082791 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000270`
名称	SmilChr05G000270
描述	uncharacterized SmilChr05G000270
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2081917 - 2082791 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984994`
GeneID	`130984994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984994`
原始查询	`LOC130984994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819039]; symbol=AT2G44310; hit=AT2G44310; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819039]; symbol=AT2G44310; hit=AT2G44310; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G44310` (AT2G44310) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819039] identity=40.5; qcov=0.945; evalue=1.9e-24; confidence=medium
Rice	`Os09g0483300` - identity=41.9; qcov=1.06; evalue=5.03e-24; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763697.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057763697.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763697.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763697.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2082252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:2082268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:2082374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:2082419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:2082487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763697.1

128 aa

128

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_5

EF-hand_1

PF13499 EF-hand_7 23-93 aa PF13202 EF-hand_5 29-47 aa PF13833 EF-hand_8 68-93 aa PF13202 EF-hand_5 69-91 aa PF00036 EF-hand_1 70-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763697.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	23	93	3.4e-13	50.4	EF-hand domain pair
`XP_057763697.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	29	47	6.8e-14	51.3	EF hand
`XP_057763697.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	68	93	3.8e-07	30.5	EF-hand domain pair
`XP_057763697.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	69	91	6.8e-14	51.3	EF hand
`XP_057763697.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	70	94	7.5e-13	47.8	EF hand domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907714.1
TTAATTTATAAAGATTTTACCATAATGTCGCATTTCAGTTTCTATATAAACAAGAAAACATATTTAAAAGCATTTCCCCACAAAATGGGAAAACGCAAACTCCACATGGCCACCTACAAATATAGAATATAAGTAGTCTTCGCCATTAATCAACAGCTACCGCGAAACACGTGCAAGCAACATCGCGCTCTCGTATAATAAACTCTTCGCTTCGCTACGTCTCCCCCAAAAATCTCAATCGGCGAAAATGAGCGTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984994
ATGAGCGTGGAATTCATCGACGGCCAGATCGTGACGGAGTTCGTGAACGACGCGCAGGCGTTCGAGAAGTGGGCGGGCGAGAAGTTCAGGGCGCTCGACGCCGACGGCAACGGCGTGCTGTCGCGCGACGAGCTGCAGAGGCGCTCCGGCAAGCTGTCGTCGACGCAGTTCGAGCTGCAGTCGGCGGACGAGATCGCGAGCCTCTACGACGTGCTGTTCAGCAGGTTCGACGCCGACGGGAGCGGGACGATCGATCCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763697.1
MSVEFIDGQIVTEFVNDAQAFEKWAGEKFRALDADGNGVLSRDELQRRSGKLSSTQFELQSADEIASLYDVLFSRFDADGSGTIDPQEFVALTREIMLAKARGIGNSPVCIILQGDSLLMRAVQRANG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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