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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000692`

染色体: Chr01 坐标: 15537074-15537938 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000692`
名称	SmilChr01G000692
描述	uncharacterized SmilChr01G000692
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	15537074 - 15537938 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984995`
GeneID	`130984995`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984995`
原始查询	`LOC130984995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G05642` (AT2G05642) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=25.8; qcov=0.96; evalue=6.22e-12; confidence=low
Rice	`Os07g0190600` - identity=21.9; qcov=0.881; evalue=5.52e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984995

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763741.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763741.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763741.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763741.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057763741.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:15537114`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A13,B105,B25,B78,C25,C34,C61,C80,C83,C9,D7
`Chr1:15537142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B92,C64,C66
`Chr1:15537157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B138
`Chr1:15537160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:15537161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A18,A21,B102,B104,B107,B113,B119,B123,B128,B133,B22,B26,B29,B3,B37,B39,B41,B42,B49,B53,B58,B62,B68,B7,B71,B72,B83,B88,B90,B92,C15,C16,C24,C25,C26,C29,C3,C35,C42,C45,C48,C5,C59,C63,C64,C66,C67,C77,C79,D10,D11,D4,D8,D9
`Chr1:15537295`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A10,B11,C27,C41,C71
`Chr1:15537295`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A10,B11,C27,C41,C71
`Chr1:15537348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A4,B137,C31,C58
`Chr1:15537610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr1:15537612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C87,D5
`Chr1:15537732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr1:15537749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763741.1

202 aa

101

202

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 81-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763741.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	81	191	7.6e-13	49.2	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907758.1
ATGGCAGGTGTTGTTAGAGTGCAGAATGGATATCGAGTTACAAAAATTCTGTTGAATGCTGATATACCCGAAGTTCATGAATTCAGGCAGAGACTTATTCACTCCAGTTTATGCACTAAAATTATTGTCAATACTTCACAACAAACAAGTTGTACTGTTAATGATGAGCTTGAGGCTGGAGTATCTGTGATAACCATAAAAGAGCTTTGTGAAAATTCAGAGGGTGGAAGCTTTTGGATATGTGGAACTGTGGTGAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984995
ATGGCAGGTGTTGTTAGAGTGCAGAATGGATATCGAGTTACAAAAATTCTGTTGAATGCTGATATACCCGAAGTTCATGAATTCAGGCAGAGACTTATTCACTCCAGTTTATGCACTAAAATTATTGTCAATACTTCACAACAAACAAGTTGTACTGTTAATGATGAGCTTGAGGCTGGAGTATCTGTGATAACCATAAAAGAGCTTTGTGAAAATTCAGAGGGTGGAAGCTTTTGGATATGTGGAACTGTGGTGAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763741.1
MAGVVRVQNGYRVTKILLNADIPEVHEFRQRLIHSSLCTKIIVNTSQQTSCTVNDELEAGVSVITIKELCENSEGGSFWICGTVVNIDGAGDWFYISCKKCSKKIEKLEHRFYCKNCSNFSESGEMKYNIIINVADESSSSPFVLWDRECKNVIGKPAAEVKVQTTTDESEVPNEIRDALLQKKYMFKIKAGDIIKPIASQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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