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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000290`

染色体: Chr05 坐标: 2223581-2226239 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000290`
名称	SmilChr05G000290
描述	uncharacterized SmilChr05G000290
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2223581 - 2226239 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985015`
GeneID	`130985015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985015`
原始查询	`LOC130985015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922548]; symbol=AT3G05345; hit=AT3G05345; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922548]; symbol=AT3G05345; hit=AT3G05345; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G05345` (AT3G05345) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922548] identity=67.9; qcov=0.768; evalue=5.84e-77; confidence=high
Rice	`Os05g0529700` (OsDjC50) - identity=30.3; qcov=0.422; evalue=8.42e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763733.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057763733.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057763734.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057763734.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2223831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B89
`Chr5:2223847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C8
`Chr5:2223882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:2224054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:2225089`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C24,C72,D6
`Chr5:2225089`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C24,C72,D6
`Chr5:2225101`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C74
`Chr5:2225101`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C74
`Chr5:2225124`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	99	A1,A11,A15,A19,A2,A20,A3,A5,A6,A8,B101,B103,B104,B107,B108,B109,B11,B114,B115,B117,B120,B121,B122,B126,B127,B128,B129,B131,B132,B139,B19,B2,B21,B25,B26,B28,B3,B30,B31,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B52,B53,B55,B58,B63,B64,B7,B75,B77,B79,B8,B80,B82,B86,B89,B9,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C2,C20,C22,C29,C3,C34,C4,C40,C48,C51,C52,C53,C55,C56,C59,C65,C69,C7,C70,C83,C87,C9,D10,D4,D8,D9
`Chr5:2225944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B100,B120
`Chr5:2225996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C74,C85,D11
`Chr5:2226042`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763733.1

280 aa

140

280

DnaJ

PF00226 DnaJ 81-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763733.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	81	138	7.3e-13	49.1	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907750.1
AAAAAACAGTTAAATTTACAGAAAAAAGCTAAAGAAAAGCCATCAATGGCGGCAGTTGCTCCTAATGAAAAGTGACAACTCTGGTTTCCTTCCCCTTCTATCAAAAATGGATCCTATTTCACTCTGCAATCGGAATTCACTTGCAACCTCACCGCCGCTCTCTGTCTTCTCTACTTTCAACGACACTCACGCTCATCACTTTCGCCTCAAACTCTTTTCTTCTTCTCCATCTAGACTGCGCTGCAGTTATAATGGCGGAA...

XM_057907751.1
AAAACAGTTAAATTTACAGAAAAAAGCTAAAGAAAAGCCATCAATGGCGGCAGTTGCTCCTAATGAAAAGTGACAACTCTGGTTTCCTTCCCCTTCTATCAAAAATGGATCCTATTTCACTCTGCAATCGGAATTCACTTGCAACCTCACCGCCGCTCTCTGTCTTCTCTACTTTCAACGACACTCACGCTCATCACTTTCGCCTCAAACTCTTTTCTTCTTCTCCATCTAGACTGCGCTGCAGTTATAATGGCGGAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985015
ATGAAAAGTGACAACTCTGGTTTCCTTCCCCTTCTATCAAAAATGGATCCTATTTCACTCTGCAATCGGAATTCACTTGCAACCTCACCGCCGCTCTCTGTCTTCTCTACTTTCAACGACACTCACGCTCATCACTTTCGCCTCAAACTCTTTTCTTCTTCTCCATCTAGACTGCGCTGCAGTTATAATGGCGGAAAAATTGCTGATACGGATGATGATGAGCCGCTCACCCTTTCTCGGGCCTATGGCGTGCTCGGACT...

LOC130985015
ATGCTCGTCTGCACAAATAAAAGCTGCTTTTCGAGCCAAAGCGAAGCAGTTTCATCCGGATGTGATGGGAGGTGCTCAGGAATCGGATGCGATGATTCGCCGTGTGATTCAAGCATACGAGGCCTTCTGCTGCATATGTGGTGGCACTCTCTTCTAACCAACAGAATTTGTTATATCAAACAGATTTTATCCAACTACAGCAAATCAGAAATTATTGAAAGGGAATGTATGGATCCATTTGAGCAACCAGAGTGTGAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763733.1
MKSDNSGFLPLLSKMDPISLCNRNSLATSPPLSVFSTFNDTHAHHFRLKLFSSSPSRLRCSYNGGKIADTDDDEPLTLSRAYGVLGLTPQCSSAQIKAAFRAKAKQFHPDVMGGAQESDAMIRRVIQAYEILSNYSKSEIIERECMDPFEQPECEAYDVFINEVLCMGKGCPYSCVSTAPHAFRFSSATGTARATSQGHAGDYQVQRAVGQCPRSCMHYVTPSQRIILEELLDSILDMPYDTSAEAEFLYSLIVKARYEN...

XP_057763734.1
MLVCTNKSCFSSQSEAVSSGCDGRCSGIGCDDSPCDSSIRGLLLHMWWHSLLTNRICYIKQILSNYSKSEIIERECMDPFEQPECEAYDVFINEVLCMGKGCPYSCVSTAPHAFRFSSATGTARATSQGHAGDYQVQRAVGQCPRSCMHYVTPSQRIILEELLDSILDMPYDTSAEAEFLYSLIVKARYENNRYQTPKKKPKVSSKHVDWL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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