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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000305`

染色体: Chr05 坐标: 2314617-2316275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000305`
名称	SmilChr05G000305
描述	peroxisomal and mitochondrial division factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2314617 - 2316275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985029`
GeneID	`130985029`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985029`
原始查询	`LOC130985029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisomal and mitochondrial division factor 2-like
产物	peroxisomal and mitochondrial division factor 2-like
Arabidopsis	`AT1G06530` (PMD2) Tropomyosin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837164] identity=28.8; qcov=0.983; evalue=2.23e-15; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28968 (PMD1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985029

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057763760.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057763760.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057763760.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057763760.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057763760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2314917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B25
`Chr5:2315000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B41,D10
`Chr5:2315084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2315090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B11,B134,B45
`Chr5:2315135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B25
`Chr5:2315158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B104,B85
`Chr5:2315158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B85
`Chr5:2315162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B85
`Chr5:2315165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B100,B12,B122,C10
`Chr5:2315166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:2315253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2315292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A8,B49,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763760.1

293 aa

146

293

PMD1-like

PF28968 PMD1-like 37-222 aa

XP_057763761.1

293 aa

146

293

PMD1-like

PF28968 PMD1-like 37-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763760.1`	Pfam	`PF28968`	PMD1-like	Coiled-coil	37	222	5.4e-22	79.2	Peroxisomal and mitochondrial division factor
`XP_057763761.1`	Pfam	`PF28968`	PMD1-like	Coiled-coil	37	222	5.4e-22	79.2	Peroxisomal and mitochondrial division factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907777.1
CATACAAAGGGCATCATTGCCTTTTTGCACGTGCTCAGCACAACTCAGTCAAGTTGGTTTCCGGTAAAATAAAAGCTATCTTCTCTTTTTCATTAAAAAATCTCAAACCCTAATTTCGGGAAACCATCAAACTCCTCCTGCAGAATAGGAATTGTAAATGGCTGATGAAACAATGATGAATGGAGAATTTTCTGATGCTCAGTCGGTGGAAATTGCTGGGGATGATGATTCGGCGAAGATATCAGGTCTTACTGAAAAGA...

XM_057907778.1
GCAGAATAGGTACGCGTGCTTTCCTTTGTTTGTACAATTTTCAGCGCAATTTCCCAGAAATGGTTTGATTATATAATAAATATGAAAAATTCCTCTATTTTTAGTTATTTTTCTCTTCACTGCGATCCTTTTGTGCTCTGTTTGGCTGCGTAGAAACGCGAACTTCTGATTCTTGTTGTTAAGAATTGTAAATGGCTGATGAAACAATGATGAATGGAGAATTTTCTGATGCTCAGTCGGTGGAAATTGCTGGGGATGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985029
ATGGCTGATGAAACAATGATGAATGGAGAATTTTCTGATGCTCAGTCGGTGGAAATTGCTGGGGATGATGATTCGGCGAAGATATCAGGTCTTACTGAAAAGATCAGTGATCTTGAGCGAGAAAATGGGAAAATTATCCGGCAAAATGAGGATTACAGGCAGAAAATCGATGAACTGAAGGCATCGATTCAAGAATTGAGCAGTGAGAATGCGGAGAGCAAGAAAGAGTTGGAAGAATTGCAATCGGAGAATAGGATGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763760.1
MADETMMNGEFSDAQSVEIAGDDDSAKISGLTEKISDLERENGKIIRQNEDYRQKIDELKASIQELSSENAESKKELEELQSENRMLGAVAARAAELEAEVSRLQHDLVSTMSDLQESNAEISDLKRDLEGAKEREKEKDVELDAMGKERDLLLAKVGKLEEDESSLRGESEGKEKEIRILKKKLEDLEVVVESNKVLEKLRSGLEKTVEQLRGKISALETSLDEKQEAITGFETKERAVAENFINGDALVDGETRGLGG...

XP_057763761.1
MADETMMNGEFSDAQSVEIAGDDDSAKISGLTEKISDLERENGKIIRQNEDYRQKIDELKASIQELSSENAESKKELEELQSENRMLGAVAARAAELEAEVSRLQHDLVSTMSDLQESNAEISDLKRDLEGAKEREKEKDVELDAMGKERDLLLAKVGKLEEDESSLRGESEGKEKEIRILKKKLEDLEVVVESNKVLEKLRSGLEKTVEQLRGKISALETSLDEKQEAITGFETKERAVAENFINGDALVDGETRGLGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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