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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000322`

染色体: Chr05 坐标: 2417577-2421707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000322`
名称	SmilChr05G000322
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2417577 - 2421707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985042`
GeneID	`130985042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985042`
原始查询	`LOC130985042`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase 1
产物	glycerol-3-phosphate acyltransferase 1
Arabidopsis	`AT1G06520` (GPAT1) glycerol-3-phosphate acyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837163] identity=52.3; qcov=1.1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0855000` (GPAT) - identity=46.9; qcov=0.918; evalue=9.43e-146; confidence=high
GO	GO:0010143 (cutin biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016791 (phosphatase activity); GO:0090447 (glycerol-3-phosphate 2-O-acyltransferase activity)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01553 (Acyltransferase); PF12710 (HAD); PF23270 (HAD_RAM2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057763783.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057763783.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763783.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763783.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2417693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C33,C62
`Chr5:2417726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:2417759`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr5:2417759`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr5:2417764`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr5:2417764`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr5:2417790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:2417819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr5:2417822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:2417852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr5:2417873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:2418071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763783.1

534 aa

267

534

HAD_RAM2_N

HAD

Acyltransferase

PF23270 HAD_RAM2_N 64-245 aa PF12710 HAD 66-220 aa PF01553 Acyltransferase 336-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763783.1`	Pfam	`PF23270`	HAD_RAM2_N	Domain	64	245	5.3e-66	222.6	Glycerol-3-phosphate acyltransferase RAM2-like, HAD-like domain
`XP_057763783.1`	Pfam	`PF12710`	HAD	Family	66	220	1.1e-08	36.4	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057763783.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	336	436	1.1e-08	35.6	Acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907800.1
CTCTTCACTTCTGTTATCACTACCACAAGGTACAACCCTCTAAAGCACAAACAGAAAAAAATGACAGTTTCCATGAGAACCATGGAGTTCCCCATGGTACTACTCAAGCTAGCCGACTGGTTCCTCTACCATTTCCTCGCCAACTCATGCTACAAAGCCGCCATGAAGCTCAAGAAATCCGCCCCCCTCCGCCCCCCGCCGCCGCACCCCAGCCTCTCCAAATTCAGCGGCGGCGGCCGGGCGTCGCAGACGCTCGTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985042
ATGACAGTTTCCATGAGAACCATGGAGTTCCCCATGGTACTACTCAAGCTAGCCGACTGGTTCCTCTACCATTTCCTCGCCAACTCATGCTACAAAGCCGCCATGAAGCTCAAGAAATCCGCCCCCCTCCGCCCCCCGCCGCCGCACCCCAGCCTCTCCAAATTCAGCGGCGGCGGCCGGGCGTCGCAGACGCTCGTCTGCGACATCCACCGCTGCCTCCTGCGGTCGCCCTCCTTCTTCCCCTACTTCATGCTCGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763783.1
MTVSMRTMEFPMVLLKLADWFLYHFLANSCYKAAMKLKKSAPLRPPPPHPSLSKFSGGGRASQTLVCDIHRCLLRSPSFFPYFMLVAFEGGGPLRALLLLLSCPLLLLLDYEAKMRAMIFITFCGMRRRGVESVSRAVLPKFYLENLNLHAVEALDSAGSRAVFTAVPRVMVEHFLKEYLAVDSVVGTELRCAGEFFTGLVSPAGLVVKHRAVKEMFGDKRPDVGIGASTLHDHLMISLCKESYVITREDNAKSSAIMPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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