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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000323`

染色体: Chr05 坐标: 2425435-2426805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000323`
名称	SmilChr05G000323
描述	uncharacterized SmilChr05G000323
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2425435 - 2426805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985043`
GeneID	`130985043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985043`
原始查询	`LOC130985043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818891]; symbol=AT2G42900; hit=AT2G42900; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818891]; symbol=AT2G42900; hit=AT2G42900; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G42900` (AT2G42900) Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818891] identity=32.1; qcov=0.851; evalue=6.54e-34; confidence=low
Rice	`Os05g0582000` - identity=36; qcov=0.789; evalue=8.5e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04450 (BSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057763785.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057763785.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057763785.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763785.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763785.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2425784`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A6,B131,B44,B55
`Chr5:2425784`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A6,B131,B44,B55
`Chr5:2425866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2425878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2425898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:2425902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B3,B60,B72,B93
`Chr5:2425941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2425942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2425982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:2426072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:2426096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr5:2426225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763785.1

289 aa

144

289

BSP

PF04450 BSP 64-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763785.1`	Pfam	`PF04450`	BSP	Family	64	277	2.1e-22	80.7	Peptidase of plants and bacteria

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907802.1
ATCCCAATATATTTTAATCAATAATTAAACCCAACGACAGCCAATCACAAGTGGATAATCCATTGACACAATTATAACGTGTCACATGCAATTTTCCAAATCTTATATACAAATATATTGGTTTTCGATTGCGACACTAATTGCCCATTTCTTCCCATCTCTTGCTCCCTAATTCCACCCACTCATGGCGGAGAGCCGCCACCTCCTCCATCTACTTTTACCCCCCTCCGCCGCCGCCGAATCCCCAGCGCCGCTCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985043
ATGGCGGAGAGCCGCCACCTCCTCCATCTACTTTTACCCCCCTCCGCCGCCGCCGAATCCCCAGCGCCGCTCGACGACGGCGACCTCAAGCTCATCTCATCGAATTCCGGCATCGTTTTCCGACTATTTTTGGTGGCGTTTATCGGCGTCGTCTCTGTATGGGCAAACCACGAAGCCTCCAAAGGCTACGCCATAACTGTAATCAACGAATCCACCAACACATTCCTCGCAACCAGATTCAAAGTCTTCTACGCATCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763785.1
MAESRHLLHLLLPPSAAAESPAPLDDGDLKLISSNSGIVFRLFLVAFIGVVSVWANHEASKGYAITVINESTNTFLATRFKVFYASNDEATRAAIKASSIIERFLFPDSDGEKNHSTKKVIKSVVIRLVDRDLTGDVAVETDSSGDRDRFVLSVSSRVLEGANFDREMALAIRRGVARVWLWDGAGDAPRNVVDGIVEYLVEICDDAAAPEVLEPPAAAAAVCWDDSSNARSVAELLRRGERRRPGFIGRLNRAMKDGWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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