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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000326`

染色体: Chr05 坐标: 2436713-2439638 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000326`
名称	SmilChr05G000326
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2436713 - 2439638 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985045`
GeneID	`130985045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985045`
原始查询	`LOC130985045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.6; qcov=1.04; evalue=7.81e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28; qcov=0.985; evalue=5.07e-68; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763787.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763787.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763787.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763787.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2437214`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A16,B108,B23,C11,C38,C69
`Chr5:2437219`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B30,D9
`Chr5:2437219`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B30,D9
`Chr5:2437245`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:2437245`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:2437247`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	168	A1,A10,A13,A14,A18,A2,A21,A22,A23,A25,A4,A7,A8,A9,B1,B101,B104,B105,B107,B109,B110,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B126,B128,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B18,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B54,B55,B59,B61,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B75,B76,B78,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C18,C2,C20,C25,C27,C28,C29,C30,C32,C33,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C61,C63,C66,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C87,D1,D10,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr5:2437250`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	151	A11,A13,A15,A16,A19,A2,A21,A22,A24,A25,A3,A7,A8,A9,B1,B101,B104,B105,B106,B11,B111,B113,B115,B117,B120,B121,B123,B124,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B46,B48,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B63,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B8,B81,B84,B86,B87,B89,B96,B97,B98,C10,C11,C15,C16,C19,C20,C23,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C68,C69,C7,C70,C72,C74,C75,C76,C8,C80,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D2,D4,D8,D9
`Chr5:2437258`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A14,A2,A23,B101,B104,B119,B129,B131,B134,B137,B23,B31,B32,B48,B61,B64,B65,B67,B71,B76,B78,B84,B88,B89,B92,B99,C11,C12,C14,C18,C25,C35,C36,C44,C47,C50,C54,C58,C66,C8,C80,C84,C87,D11,D8
`Chr5:2437260`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	47	A14,A2,A23,B101,B104,B119,B129,B131,B134,B137,B23,B31,B32,B48,B61,B64,B65,B67,B71,B72,B76,B78,B84,B88,B89,B92,B99,C11,C12,C14,C18,C25,C35,C36,C44,C47,C50,C54,C58,C66,C75,C8,C80,C84,C87,D11,D8
`Chr5:2437265`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	93	A1,A18,A21,A22,A25,A4,A7,A9,B1,B104,B107,B110,B114,B117,B118,B120,B121,B126,B129,B131,B132,B133,B136,B138,B139,B2,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B48,B49,B51,B52,B54,B59,B68,B69,B7,B73,B75,B82,B85,B87,B9,B95,B97,C1,C13,C2,C27,C29,C30,C33,C37,C39,C4,C40,C42,C43,C48,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C63,C7,C70,C71,C73,C76,C77,C78,C82,D10,D3,D4,D5,D9
`Chr5:2437269`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A1,A18,A21,A22,A25,A4,A7,A9,B104,B107,B110,B114,B117,B120,B121,B126,B129,B133,B136,B137,B138,B139,B2,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B35,B37,B38,B39,B40,B42,B44,B48,B49,B51,B52,B54,B55,B59,B68,B69,B7,B73,B75,B82,B87,B9,B97,C1,C13,C14,C18,C2,C20,C27,C29,C30,C33,C39,C4,C42,C43,C52,C53,C55,C57,C58,C6,C63,C7,C70,C71,C73,C74,C76,C77,C78,C8,C82,C87,D10,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr5:2437275`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A13,A19,A22,B104,B117,B137,B18,B25,B40,B43,B46,B48,B54,B57,B73,C28,C29,C30,C34,C37,C43,C52,C57,C61,C72,C74,C75,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763787.1

739 aa

370

739

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 52-214 aa PF23559 WHD_DRP 298-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763787.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	52	214	1.1e-40	139.8	NB-ARC domain
`XP_057763787.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	298	368	6e-20	71.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907804.1
ACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCCAATTTCTCCAAGGCTATAACCCCCATCGTGACTACTCCCAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATGAGGTGAAAAATGATGGCTTGTATGAAGCTCTCGAGAAGGTGATAGAAGACATGGCTTCTATCGAAGAGGAGGCTAAGCAAATTCAAGGGAGAGTTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985045
ATGGCTTCTATCGAAGAGGAGGCTAAGCAAATTCAAGGGAGAGTTGGAGTCCAACATCAGCTGCACACAAAGTCAACGCCTTTGGATTCCTCGAGATCTTCTTCGATCCCTCAGCAGAATAGCATGGTGGGTGCTGATGATGTCAAGCTTCAATTAATGGATAAGCTCACTTCTGATCTCCTTCATCTGCAAATCATTCCCATTGTAGGGATGGGCGGCTCCGGTAAGACCACTCTTGCTAGATCTGTTTATGAAGAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763787.1
MASIEEEAKQIQGRVGVQHQLHTKSTPLDSSRSSSIPQQNSMVGADDVKLQLMDKLTSDLLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARSVYEERLIKEHFDICAWATISQEYVIRDIFAVVLRQFNIGVADDLNEHELGEKLYKHLYGRRYLIIMDDMWSIDAWDRVRNYFPNNENGSRIVVTTRLSDLASTLPNSNSLGMELLDEAHSWELLSKTVFGKEGCPLELEEIAKKIGKSCKGLPLSIVVVGGLLAKSKHERKFWEYIGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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