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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000356`

染色体: Chr05 坐标: 2671175-2673708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000356`
名称	SmilChr05G000356
描述	uncharacterized SmilChr05G000356
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2671175 - 2673708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985071`
GeneID	`130985071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985071`
原始查询	`LOC130985071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834030]; symbol=AT5G40320; hit=AT5G40320; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834030]; symbol=AT5G40320; hit=AT5G40320; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G40320` (AT5G40320) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834030] identity=29.7; qcov=0.821; evalue=3.3e-41; confidence=low
Rice	`Os07g0611400` (OJ1003_H02.109) - identity=28.9; qcov=0.299; evalue=7.53e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057763828.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057763828.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763828.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763828.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2671376`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B125,B90,C20
`Chr5:2671376`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B125,B90,C20
`Chr5:2671380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,C33,C62,D9
`Chr5:2671411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B4,B67,C58,C81
`Chr5:2671415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:2671422`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A9,B67
`Chr5:2671422`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A9,B67
`Chr5:2671423`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A7,B7,C15,C18,C60,C80
`Chr5:2671425`	`TAG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B39,C20,C34
`Chr5:2671426`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A7,B7,C15,C18,C60,C80
`Chr5:2671428`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A9,B67
`Chr5:2671428`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A9,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763828.1

603 aa

302

603

C1_2

PF03107 C1_2 121-166 aa PF03107 C1_2 478-526 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763828.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	121	166	1.7e-45	153.8	C1 domain
`XP_057763828.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	478	526	1.7e-45	153.8	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907845.1
CGTTTGTGGTTTTGGTAGTATATCACCATATGATCAAAGTTATAGTAATCATAAACAACAAATTGAAGTATTGGTTTTGCTCTCTTTGCTGTGTAGAAGAGACAAAATGAGCTCTCACACTACAATATGGAGTGATGAAAACGGCGTAGATCCAGACGACGGAAATTCTTGGATGTGCAGTGCTTGTACGCTCCCAATCTTCTCCACGCCCTTCACCACCATCAACACCAAACACGGTCAAGTGCTCCTGCACGATCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985071
ATGAGCTCTCACACTACAATATGGAGTGATGAAAACGGCGTAGATCCAGACGACGGAAATTCTTGGATGTGCAGTGCTTGTACGCTCCCAATCTTCTCCACGCCCTTCACCACCATCAACACCAAACACGGTCAAGTGCTCCTGCACGATCAATGCGCTAATCTCCCCAAGAAATTGATGGATAATGCGTTTCACCCCGGCGCGCCCCTCATGCTCAAGGAAAACTGGGATTCATCATCATCACAATCTTGCCGTGAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763828.1
MSSHTTIWSDENGVDPDDGNSWMCSACTLPIFSTPFTTINTKHGQVLLHDQCANLPKKLMDNAFHPGAPLMLKENWDSSSSQSCRECGKKCGSMFYQCLDSSCDLRFDLLCSLQIKILHRSHKHRLTMVRGRAAFRCSACGTQHEGLSSPSYLCTACGVWIHKDCASSPNAIRLVQPQQHQHSLFLTYNIIHAFPARDCKCAFCGERILLYSVGAYFCFKCSYFAHIRCATSDPRCFESVLIRDAKLADLLHLPMADERT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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