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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000368`

染色体: Chr05 坐标: 2737373-2739173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000368`
名称	SmilChr05G000368
描述	berberine bridge enzyme-like 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2737373 - 2739173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985085`
GeneID	`130985085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985085`
原始查询	`LOC130985085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	berberine bridge enzyme-like 18
产物	berberine bridge enzyme-like 18
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=49.7; qcov=0.985; evalue=3.75e-177; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=46.6; qcov=0.987; evalue=1.03e-153; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057763840.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057763840.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763840.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763840.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2737451`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	176	A1,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B101,B105,B106,B109,B11,B110,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B27,B29,B30,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B51,B54,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B71,B76,B78,B8,B81,B82,B84,B85,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C12,C13,C14,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C41,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C9,D11,D2,D3,D4,D6,D7
`Chr5:2737501`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A1,A19,A23,B106,B110,B118,B120,B125,B131,B2,B25,B29,B42,B43,B47,B49,B78,B90,B92,B95,C10,C14,C24,C28,C30,C34,C37,C4,C41,C43,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C61,C63,C72,C82,C83,C84
`Chr5:2737676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B67,C59
`Chr5:2737769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,B41,B68,D10
`Chr5:2737790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:2737795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B10,B58,C4,D11
`Chr5:2737806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr5:2737820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C14
`Chr5:2737929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B31,B61,C18,C55
`Chr5:2737945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:2737973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C4
`Chr5:2737979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763840.1

537 aa

268

537

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 80-216 aa PF08031 BBE 472-530 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763840.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	80	216	6.9e-25	88.1	FAD binding domain
`XP_057763840.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	472	530	5.8e-22	78.1	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907857.1
TTGCATACTTCTCAAACATCACAAACACATATCTTCACAAATCATGAAAATTAATTTAATCTCAACTCTCTCATTCTTTTTTCTTCTTCTCATCTCGTCGTACCCATCGGCAGAAGCTTCTGCCGATGGAGGCGACGATTTTCTCCGATGTCTCTCTCAACAATCCCATAATTACTCCTCCTTCACCAACGTCGTCTACACCACAAACACCACATCGTACACTTCCGTCCTTCAATCATCCATCAAGAATCTGAGATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985085
ATGAAAATTAATTTAATCTCAACTCTCTCATTCTTTTTTCTTCTTCTCATCTCGTCGTACCCATCGGCAGAAGCTTCTGCCGATGGAGGCGACGATTTTCTCCGATGTCTCTCTCAACAATCCCATAATTACTCCTCCTTCACCAACGTCGTCTACACCACAAACACCACATCGTACACTTCCGTCCTTCAATCATCCATCAAGAATCTGAGATTCGCGTCAGACTCGACTCCCAAACCGCACGTGATCATAACTCCACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763840.1
MKINLISTLSFFFLLLISSYPSAEASADGGDDFLRCLSQQSHNYSSFTNVVYTTNTTSYTSVLQSSIKNLRFASDSTPKPHVIITPRHESQIPPVINCAKHNDLEVRIRSGGHDYEGLSYVSQVPFAIIDLINLSEVTVDAEAKTAWVESGATIGTLYYRIAEKSPVLGFPAGLCATVGVGGQFSGGGYGMMVRRFGLAADHVIDARIIDANGRILDRESMGEDLFWAIRGGGGASFGVILAWKVRLVDVPEKVTVFAVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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