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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002613`

染色体: Chr01 坐标: 44391884-44396531 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002613`
名称	SmilChr01G002613
描述	plant UBX domain-containing protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44391884 - 44396531 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985120`
GeneID	`130985120`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985120`
原始查询	`LOC130985120`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant UBX domain-containing protein 8-like
产物	plant UBX domain-containing protein 8-like
Arabidopsis	`AT4G11740` (SAY1) Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826779] identity=43.2; qcov=1.11; evalue=8.18e-114; confidence=medium
Rice	`Os08g0546400` - identity=42.7; qcov=1.09; evalue=2.5e-123; confidence=medium
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00789 (UBX); PF14555 (UBA_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985120

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763897.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763897.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057763897.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057763897.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44392133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:44392312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:44393608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B26,B80,C38,C60
`Chr1:44393808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D7
`Chr1:44393878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:44393926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:44394224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C38
`Chr1:44394262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:44394316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B63,C15,C55,C57
`Chr1:44394704`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B104,B131,C57,C86
`Chr1:44394704`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B104,B131,C57,C86
`Chr1:44394707`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B104,B131,C57,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763897.1

559 aa

280

559

UBA_4

UBX

PF14555 UBA_4 6-47 aa PF00789 UBX 478-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763897.1`	Pfam	`PF14555`	UBA_4	Domain	6	47	1.3e-11	44.8	UBA-like domain
`XP_057763897.1`	Pfam	`PF00789`	UBX	Domain	478	557	1.2e-18	67.8	UBX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907914.1
TTAAATTCCCAAACTTTTGCACTATTTACTAATTGCCCCTACTCCAAACGAAAATGACCGCTGACTCCTCATCCCTATATATTACAATTTCCCCATTCCAAATTTCTTCTCATCTTCTGCAAACCAAAAAAATTAATTATTGTAATCTGGAAAATGGCGAGACCTGATCAAGAAGCAATCGACACTTTCATAAGCATCACCGGTGTTTCTGAAGCGGCAGCCGTTCGAAAATTGGAGGAGCATCATGGCAGCCTCAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985120
ATGGCGAGACCTGATCAAGAAGCAATCGACACTTTCATAAGCATCACCGGTGTTTCTGAAGCGGCAGCCGTTCGAAAATTGGAGGAGCATCATGGCAGCCTCAACGAAGCTGTTAATGCGCATTTCACTGAAGGGGATAGAAACATAGTCCAAGAGGCATCTTTTGGTGTTCCTGGGGACAACATTATGGATATTGATGATCCAATTCAAGTCGAGCCCCCTAGACCACATTCTTCCTTGCCACCATTTGCTAGAGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763897.1
MARPDQEAIDTFISITGVSEAAAVRKLEEHHGSLNEAVNAHFTEGDRNIVQEASFGVPGDNIMDIDDPIQVEPPRPHSSLPPFARDVNHSSSIEPNFRTSLIDSVTGIAPDKVKDGTGTSAQSGSAPNDGDDDDENIPNLGRITDIEGHAIRSSSDQHGPTAPTVIDVPDDSYDIEEEMIQAAIEASRQDAAMPNQQYDHLDPGDPIQSVQSNREDAEISHAVSLSLQTAEKDEVLEELEGQVGASQQETQKSSSDEMGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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