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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000404`

染色体: Chr05 坐标: 3044021-3048133 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000404`
名称	SmilChr05G000404
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g30440
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3044021 - 3048133 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985121`
GeneID	`130985121`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985121`
原始查询	`LOC130985121`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g30440
产物	BTB/POZ domain-containing protein At1g30440
Arabidopsis	`AT1G30440` (AT1G30440) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839923] identity=72; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0130600` (P0582D05.131) - identity=67.5; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985121

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057763893.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057763893.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057763893.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763893.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3044266`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A25,B107,B111,B115,B119,B124,B128,B129,B138,B14,B22,B24,B3,B38,B39,B4,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B76,B79,B81,B88,B91,B93,B99,C12,C13,C15,C17,C19,C31,C42,C52,C57,C59,C79,C84,C86,C87,D9
`Chr5:3044362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B105,B44,B54
`Chr5:3044374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B31,B35,B50
`Chr5:3044380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C23,C42,C62,D10
`Chr5:3044387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:3044416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3044470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B124
`Chr5:3044500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr5:3044501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:3044554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B131,C46
`Chr5:3044563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B44,B54
`Chr5:3044623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763893.1

639 aa

320

639

BTB

NPH3

PF00651 BTB 26-114 aa PF03000 NPH3 213-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763893.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	26	114	1.1e-08	35.9	BTB/POZ domain
`XP_057763893.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	213	478	1.3e-95	320.6	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907910.1
GACTCGAAGCGGACGGCTGTTACTTTCAAAATTCATGGCAGGTAATGTATAGAAGAAAAAGAAACAAAATCGATTTTTAGTGATATTTCGTTTCTTGCTACAGATTAAGAAATTAAGCCTTTTACACACCATGATGCAGCAAACACTGTGACAAATATATAATTCTAAAATATGGTTACTGACTTTAAAGAATTTGGAATCTCTATGCAATGAGTGTGTTTGAAGGCAACGGACCCACATGGTAATTAATTTGTGTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985121
ATGGCTTGTATGAAGTTGGGATCCAAAACTGATGCATTCCAGCGGCAAGGGCAAGCCTGGTTCTGCACTACTGGTCTCCCTAGTGATGTAGTTGTCGAGGTTGAGGAAATGTCGTTTCATCTTCACAAGTTTCCGTTGCTTTCACGCAGCGGGGTGATGGAGCGTCTCATTGCAGAGGCGTCCGAGGGAGACGAAGGCTGCGTGATCAAGCTCTCCGATGTCCCCGGTGGGGCAAAAACGTTTGAGCTCGTAGCTAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763893.1
MACMKLGSKTDAFQRQGQAWFCTTGLPSDVVVEVEEMSFHLHKFPLLSRSGVMERLIAEASEGDEGCVIKLSDVPGGAKTFELVAKFCYGVKLELTASNVVYLRCAAEHLEMTDEFGEGNLVSQTEIFLNQTALRSWKDSLKALQTCDDVLSDAEQLHIPRRCIDSLAAKACTDPALFGWPMMERGGPMQSPGGSVLWNGISTGARPKHSSADWWYDDASTLSLPLYRRLISVMESRGVKQEIVAGSLVCYARKYLPGLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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