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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000411`

染色体: Chr05 坐标: 3119076-3121405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000411`
名称	SmilChr05G000411
描述	cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP35
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3119076 - 3121405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985130`
GeneID	`130985130`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985130`
原始查询	`LOC130985130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP35
产物	cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP35
Arabidopsis	`AT5G50960` (NBP35) nucleotide binding protein 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835169] identity=78.8; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0485400` (OsISC44) - identity=81.1; qcov=0.827; evalue=1.22e-176; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0140663 (ATP-dependent FeS chaperone activity)
KEGG	-
Pfam	PF01656 (CbiA); PF02374 (ArsA_ATPase); PF10609 (ParA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985130

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763913.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763913.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057763913.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763913.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763913.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3119392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:3119518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:3119548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr5:3120357`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B12,B2,B23,B68,B94
`Chr5:3120357`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B12,B2,B23,B68,B94
`Chr5:3120377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B63,C12,C53
`Chr5:3120428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3120554`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A7,B12,B130,B2,B21,B23,B63,B68,B94,C12,C53,C81
`Chr5:3120625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B131,B23
`Chr5:3120654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:3120670`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B12,B130,B2,B23,B63,B94,C12,C53
`Chr5:3121042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763913.1

359 aa

180

359

ParA

ArsA_ATPase

CbiA

ParA

PF10609 ParA 60-261 aa PF02374 ArsA_ATPase 62-99 aa PF01656 CbiA 64-321 aa PF10609 ParA 283-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763913.1`	Pfam	`PF10609`	ParA	Family	60	261	2.5e-90	302.9	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase
`XP_057763913.1`	Pfam	`PF02374`	ArsA_ATPase	Domain	62	99	5.8e-07	29.7	Anion-transporting ATPase
`XP_057763913.1`	Pfam	`PF01656`	CbiA	Domain	64	321	8.6e-12	45.8	CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain
`XP_057763913.1`	Pfam	`PF10609`	ParA	Family	283	343	2.5e-90	302.9	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907930.1
TCTTTTTGCCCTTTTTCTCTGATAAATGATGACCTTTTCTTTTAGGAAATTTTTTCTGAAACAGCTTTTCGTATAAGAAATTAAATGATGATTTTTTAAACCTCACAATAAAAAGATTAACAAACGAAAAGTGTTGCAAACCCCACAAAAGAAGAAAAGTCTGACTTTGGCGGCCTTCTCTCTCTAGGGTTTTTGAGAGCTTAATTTCTCTCTCTTTAGCAAATCTTTGGACCGAAATACTTCGCAGGAACTCGTCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985130
ATGGAAAACGGAGGCTACGAAGTACCTGAAAACGCCAATGAAGATTGCCCAGGAACGGAGTCGGAATCGGCTGGCAAATCCGAAGCTTGCGCGGGATGCCCTAATCAGGAAGCTTGTGCTACTGCTCCCAAAGGACCCGATCCAGACTTGGTCACTATCGTTGAAAGAATGGCAACAGTTAAACACAAAATACTAGTATTGTCTGGAAAGGGTGGTGTTGGGAAGAGTACAGTTTCAGCTCAATTATCTTTTGCCCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763913.1
MENGGYEVPENANEDCPGTESESAGKSEACAGCPNQEACATAPKGPDPDLVTIVERMATVKHKILVLSGKGGVGKSTVSAQLSFALAAMDFQVGLLDIDICGPSIPKMLGLEGQEIHQSNLGWSPVYVESNLGVMSIGFMLPNPDDAVIWRGPRKNGIIKQFLKDVYWGDLDFLVVDAPPGTSDEHISIVQFLQATGIDGAIIVTTPQQVSLIDVRKEVSFCKKVGLQVLGVVENMSGLCQPMSDLKFLNITETGEQKDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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