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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000418`

染色体: Chr05 坐标: 3160583-3163181 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000418`
名称	SmilChr05G000418
描述	putative F-box/LRR-repeat protein 23
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3160583 - 3163181 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985136`
GeneID	`130985136`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985136`
原始查询	`LOC130985136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein 23
产物	putative F-box/LRR-repeat protein 23
Arabidopsis	`AT4G05460` (AT4G05460) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825896] identity=41.9; qcov=0.8; evalue=1.67e-57; confidence=medium
Rice	`Os02g0317300` (OsFbox086) - identity=36.2; qcov=0.756; evalue=8.53e-38; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985136

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763922.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057763922.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763922.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3160903`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr5:3160903`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr5:3160912`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A20,A7,B117,B120,B137,B27,B47,B6,B60,B79,B84,B9,C18,C34,C56,C63,C67
`Chr5:3160940`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	98	A1,A13,A20,A21,A22,A5,A6,A7,B102,B104,B107,B11,B117,B120,B124,B125,B129,B131,B133,B134,B137,B138,B139,B16,B17,B21,B23,B27,B31,B35,B4,B40,B42,B43,B47,B49,B51,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B66,B67,B69,B70,B71,B79,B8,B80,B82,B84,B85,B88,B9,B90,B92,B94,B95,B99,C15,C18,C2,C22,C24,C26,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C39,C42,C44,C45,C47,C49,C53,C55,C56,C57,C63,C64,C66,C67,C68,C71,C74,C76,C87,D10,D11,D2,D4,D6
`Chr5:3160999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3161022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B91,C4
`Chr5:3161085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B91,C4
`Chr5:3161105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B91,C4
`Chr5:3161158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C44,D1,D7
`Chr5:3161174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B91,C4
`Chr5:3161204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B14,C14
`Chr5:3161221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763922.1

340 aa

170

340

F-box-like

PF12937 F-box-like 26-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763922.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	26	66	3.2e-07	30.7	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907939.1
TTTTTCTTTTCAAAATCATTGTATATCCAGTTTATCTCTCTCACAATCCCCATCCCTTTGCTCTCTCTCACTTCTCTCGGCCGTCTGGCGAGAAATCTGTCACCGCCGCTGCGCTCCTCATCCGGTCGCGTCTATCCGCTGACTCCGCCGTAGCAGCAGTTTCCAACGCCCACATTTCGGTATTGCAGATGGAAAGAGGGAAAACTCCGCCGCCGCCGCCAGCTGCTTCATCCTCGGCCTCTCCGCCGCCATGGATCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985136
ATGGAAAGAGGGAAAACTCCGCCGCCGCCGCCAGCTGCTTCATCCTCGGCCTCTCCGCCGCCATGGATCGAACCTCCCGAAGATGTAACGGTCAACATTCTCCAGAGGTTGGGCGCGGAGGAGAAGCTAAGCGCGCAACTAGTGTGTAGTAGCTGGTGGAAAGTTTGCAAGGATCCCGCCATGTGGCGAGTGATCGATTTGTGCAACCCTGATTCTGATTCTAGGACTGTGAAAAAGGAGTACGTTGCCATGTGCCGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763922.1
MERGKTPPPPPAASSSASPPPWIEPPEDVTVNILQRLGAEEKLSAQLVCSSWWKVCKDPAMWRVIDLCNPDSDSRTVKKEYVAMCRRAVDRSQGQLVDFAIDSFGDGELINYVVDRAQNLKRLKLVSCNEMSGGPFIQAVEKLRQLEELHLTMIPCIYAHHIEAIGSSCPKLKSFSYNECGSKHQLPPDSEDEDIDEGLDVNDYARAIGKCMPNLHHLQLSGYEMQDEGLEAILDGCPRLVSLDIRQCSGLALRGDLGNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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