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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000420`

染色体: Chr05 坐标: 3174807-3178989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000420`
名称	SmilChr05G000420
描述	F-box protein SKIP19-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3174807 - 3178989 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985137`
GeneID	`130985137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985137`
原始查询	`LOC130985137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP19-like
产物	F-box protein SKIP19-like
Arabidopsis	`AT4G05460` (AT4G05460) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825896] identity=36.6; qcov=0.842; evalue=4.6e-65; confidence=medium
Rice	`Os02g0317300` (OsFbox086) - identity=30.4; qcov=0.756; evalue=1.04e-38; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763923.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763923.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763923.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763923.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763923.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3175098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr5:3175107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3175150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C41,C52
`Chr5:3175180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B90,B92
`Chr5:3175238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B82,C78,D1
`Chr5:3175248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C78,D1
`Chr5:3175256`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B82,C78,D1
`Chr5:3175256`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B82,C78,D1
`Chr5:3175263`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B3,B82,B99,C31,C76,C78,C87,D11
`Chr5:3175272`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B82,C78
`Chr5:3175272`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B82,C78
`Chr5:3175278`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B82,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763923.1

431 aa

216

431

F-box-like

PF12937 F-box-like 73-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763923.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	73	119	1e-05	25.9	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907940.1
CGTACACGGCCCAAAATACTTTGCCCCTAAATATTCACCCAAATAAACAAACCTTTTCAAAATCCTCTCCTTACCATTATTCTGCGTTTTCAATCGCCATGGGAAGGAGGAAAAGCAGAAACCTAAAACAGTGGGTTCCAAAGAAAACTCCGGCGCCGGCGCCAGCTGCTTCATCCTCGGCCCCTCCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGGAGATGTAACGGCCAACAGGAAAAGCAGAATCCGAAAACAGTGGGTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985137
ATGGGAAGGAGGAAAAGCAGAAACCTAAAACAGTGGGTTCCAAAGAAAACTCCGGCGCCGGCGCCAGCTGCTTCATCCTCGGCCCCTCCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGGAGATGTAACGGCCAACAGGAAAAGCAGAATCCGAAAACAGTGGGTTCCAAAGAAAACTCCGGCGCCGGCGCCAGCTGCTTCGTCCTCGGCCCCTTCGCCGCCGTGGATCGAACTTCCCGGAGATGTAACGGCCAACATTCTGCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763923.1
MGRRKSRNLKQWVPKKTPAPAPAASSSAPPPPWIELPGDVTANRKSRIRKQWVPKKTPAPAPAASSSAPSPPWIELPGDVTANILQRLGAVGMLRSAQRVCSTWWKVCKDPAMWRVIVLHYPRMIDTYTAMSMCRPEVDWNQRQLVDLAIDPFGNDELINYVADRYRKISNEDYIAMCRHAVDRSQGQLVDLTIEYFGDGELINYIADRSRNLKRLKLVFCHQMSEGPLVQAIEKFEQLEELHLTMLPWISPDQIEAIGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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