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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000436`

染色体: Chr05 坐标: 3303914-3307791 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000436`
名称	SmilChr05G000436
描述	CSC1-like protein ERD4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3303914 - 3307791 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985156`
GeneID	`130985156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985156`
原始查询	`LOC130985156`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CSC1-like protein ERD4
产物	CSC1-like protein ERD4
Arabidopsis	`AT1G30360` (ERD4) Early-responsive to dehydration stress protein (ERD4) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839916] identity=63.5; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0150100` (OsOSCA3.1) - identity=60.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005227 (calcium-activated cation channel activity); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02714 (RSN1_7TM); PF13967 (RSN1_TM); PF14703 (PHM7_cyt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057763944.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763944.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763944.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763944.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3304206`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B103
`Chr5:3304206`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B103
`Chr5:3304336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B15,B19,B29,C7
`Chr5:3304429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B34
`Chr5:3304465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3304513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:3305385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:3305536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B124,B82
`Chr5:3305869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B104,B123,C48,D4
`Chr5:3306256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:3306646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B33,C26,C74
`Chr5:3306659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B132,B133,B25,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763944.1

725 aa

362

725

RSN1_TM

PHM7_cyt

RSN1_7TM

PF13967 RSN1_TM 5-166 aa PF14703 PHM7_cyt 188-355 aa PF02714 RSN1_7TM 366-637 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763944.1`	Pfam	`PF13967`	RSN1_TM	Family	5	166	2.7e-35	122.0	Late exocytosis, associated with Golgi transport
`XP_057763944.1`	Pfam	`PF14703`	PHM7_cyt	Domain	188	355	3.3e-33	116.1	Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter
`XP_057763944.1`	Pfam	`PF02714`	RSN1_7TM	Family	366	637	4.7e-82	276.1	Calcium-dependent channel, 7TM region, putative phosphate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907961.1
GCTCTCTAAAAATCCTCCTCACTTTGCTCCCTCCAAATCCGGCTTGCCTCACTAATCTCGCACACGCACTACACACACTTTCCCTGCGTCGACACAAAAGCAGATAAAGTAAAAGCCAAAATTGAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCATTTCTTCGTTCAAACCCTCAAATCCATGGGGAAAACAGAAAAAGGAAATTGCGAGAAACCCCACATTCCATAAATACCAAACTCTCGCAATCAATTTGCAGAGAAGATATTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985156
ATGGATTTCAGCTCGTTCCTGACGTCGCTGGGGACGTCGTTTGTGGTTTTCCTGATTTTGATGTTCCTCTTCGCGTGGCTCTCCAGGCGACCCGGCAACCACGTCATCTACTATCCGAATCGGATCCTGAGAGGTCTGGACGCCTACGAGGGAATCCGGCTCACCCGCAACCCGTTTACTTGGATCAAGGAAGCTGTCTCCTCCACTGAGGCTGATGTCATCAGAGACTCCGGCGTTGATGCTGCCGTCTATTTTGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763944.1
MDFSSFLTSLGTSFVVFLILMFLFAWLSRRPGNHVIYYPNRILRGLDAYEGIRLTRNPFTWIKEAVSSTEADVIRDSGVDAAVYFVFLSTALAILVLSGVILLPVLLPVAYTAENKIDANETTSKGAFNELDKLSMAHIAEKSHRLWAFLAATYWVSFVTYYLLWRAYRHVSNVRAEALMSPEVKNEQFAVLVRDIPAVNEGQTINEQVDSYFKAIYPDTYYKSMVITDNKVANKIYKELEGYRKKLARAEAVYAQSKGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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