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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000439`

染色体: Chr05 坐标: 3320078-3323383 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000439`
名称	SmilChr05G000439
描述	WD repeat-containing protein LWD1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3320078 - 3323383 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985159`
GeneID	`130985159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985159`
原始查询	`LOC130985159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD repeat-containing protein LWD1-like
产物	WD repeat-containing protein LWD1-like
Arabidopsis	`AT1G12910` (ATAN11) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837849] identity=90.5; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0524600` (OsTTG1B) - identity=69.7; qcov=1.1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763949.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057763948.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057763948.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057763948.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057763948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3320314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:3320392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:3320560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:3320635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C33
`Chr5:3320830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr5:3320935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B108
`Chr5:3320962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B67,C48
`Chr5:3321004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763948.1

348 aa

174

348

WD40

PF00400 WD40 176-207 aa PF00400 WD40 262-298 aa

XP_057763949.1

348 aa

174

348

WD40

PF00400 WD40 176-207 aa PF00400 WD40 262-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763948.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	176	207	2.8e-12	47.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057763948.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	262	298	2.8e-12	47.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057763949.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	176	207	2.8e-12	47.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057763949.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	262	298	2.8e-12	47.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088906.1
ATGGGTGCGAGCAGCGATCCGAATCAGGACGGGTCGGACGAGCAGCAGCGGCGGTCGGAGATCTACACCTACGAAGCTCCATGGCACATCTATGCCATGAACTGGAGCGTGCGCAAGGACAAGAAATACCGCCTCGCCATCGCCAGCCTCCTCGAGCAGTACCCTAACCGCGTTGAAATCGTCCAGCTCGACGACTCCACCGGAGAGATCCGCTCCGACCCGGCCATCTCCTTCGACCACCCCTACCCGCCGACCAAGCT...

XR_009088905.1
ATGGGTGCGAGCAGCGATCCGAATCAGGACGGGTCGGACGAGCAGCAGCGGCGGTCGGAGATCTACACCTACGAAGCTCCATGGCACATCTATGCCATGAACTGGAGCGTGCGCAAGGACAAGAAATACCGCCTCGCCATCGCCAGCCTCCTCGAGCAGTACCCTAACCGCGTTGAAATCGTCCAGCTCGACGACTCCACCGGAGAGATCCGCTCCGACCCGGCCATCTCCTTCGACCACCCCTACCCGCCGACCAAGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985159
ATGGGTGCGAGCAGCGATCCGAATCAGGACGGGTCGGACGAGCAGCAGCGGCGGTCGGAGATCTACACCTACGAAGCTCCATGGCACATCTATGCCATGAACTGGAGCGTGCGCAAGGACAAGAAATACCGCCTCGCCATCGCCAGCCTCCTCGAGCAGTACCCTAACCGCGTTGAAATCGTCCAGCTCGACGACTCCACCGGAGAGATCCGCTCCGACCCGGCCATCTCCTTCGACCACCCCTACCCGCCGACCAAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763948.1
MGASSDPNQDGSDEQQRRSEIYTYEAPWHIYAMNWSVRKDKKYRLAIASLLEQYPNRVEIVQLDDSTGEIRSDPAISFDHPYPPTKLIFVPDKECQRPDLLASSSDFLRLWQISDSDGGRRVELKSLLNNNRNSEFSGPLTSFDWNEAEPRRIGTSSIDTTCTIWDIEKEMVDTQLIAHDKEVYDIAWGGVGVFASVSADGSVRVFDLRDKEHSTIIYESSEPDTPLVRLGWNKQDPRYMATIIMDSSKVVVLDIRFPTL...

XP_057763949.1
MGASSDPNQDGSDEQQRRSEIYTYEAPWHIYAMNWSVRKDKKYRLAIASLLEQYPNRVEIVQLDDSTGEIRSDPAISFDHPYPPTKLIFVPDKECQRPDLLASSSDFLRLWQISDSDGGRRVELKSLLNNNRNSEFSGPLTSFDWNEAEPRRIGTSSIDTTCTIWDIEKEMVDTQLIAHDKEVYDIAWGGVGVFASVSADGSVRVFDLRDKEHSTIIYESSEPDTPLVRLGWNKQDPRYMATIIMDSSKVVVLDIRFPTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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