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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000460`

染色体: Chr05 坐标: 3470457-3478235 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000460`
名称	SmilChr05G000460
描述	F-box protein At5g46170-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3470457 - 3478235 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985181`
GeneID	`130985181`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985181`
原始查询	`LOC130985181`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g46170-like
产物	F-box protein At5g46170-like
Arabidopsis	`AT5G46170` (AT5G46170) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834659] identity=67.1; qcov=1.04; evalue=4.92e-173; confidence=high
Rice	`Os01g0770400` (OsFbox040) - identity=58.8; qcov=1.03; evalue=1.1e-146; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985181

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763986.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763986.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763986.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763986.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057763986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3476796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:3476942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:3476975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B41,B58
`Chr5:3476984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C78
`Chr5:3477050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:3477149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B19,B44,B55,C30
`Chr5:3477257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B131
`Chr5:3477273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B27,C12,C22
`Chr5:3477341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:3477460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B37,C27
`Chr5:3477469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3477699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763986.1

373 aa

186

373

F-box-like

PF12937 F-box-like 20-55 aa

XP_057763987.1

373 aa

186

373

F-box-like

PF12937 F-box-like 20-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763986.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	20	55	9.5e-07	29.2	F-box-like
`XP_057763987.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	20	55	9.5e-07	29.2	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088915.1
AAAAAGGGAAAAGAAAAGAAACACGCACAACACACACCACCATTTTTCCCTTCCTCCTTCTCCTTCACTCACTTCCCCCAAATTCCCCCACCTCAATAAACTCGCACCCTAATTCCACAAATTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCCCTTTCTCTCCCTCTCTCTACATATTTTCTGTCAGATCCATTGAGTTTGTAGGCTCAATTTCTTTGTTTTAAATCTTTCTGCCGAAGCTCGCTCGCAATTACGTTTCGATTCTCCGTA...

XM_057908004.1
ATCTACAATCTACTGTATTTGGCACTAAAAAAGCAAAGGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGGGAAAAGAAAAGAAACACGCACAACACACACCACCATTTTTCCCTTCCTCCTTCTCCTTCACTCACTTCCCCCAAATTCCCCCACCTCAATAAACTCGCACCCTAATTCCACAAATTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCCCTTTCTCTCCCTCTCTCTACATATTTTCTGTCAGATCCATTGAGTTTGTAGGCTCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985181
ATGGGATCGATTGGGGCAGATCTGTGCCGAAAAATCTACCCGGAGCCGGTGGACGAATTCGACCGGCTGCCGGACTCGCTCATCCTCTTGATCTTCAACCAAATCGGGGACGTGAAGGCGTTGGGCCGATGCTGCGTCGTTTCGAGGCGGTTCCACTCGCTCGTTCCCCAAGTCGACAACGTTGTTGTCCGCGTCGACTGCGTAATCTCCGACGACGATCCCTCCTCCAACTCTTCGTCGGCGGCCGCTTCCGCGGCCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763986.1
MGSIGADLCRKIYPEPVDEFDRLPDSLILLIFNQIGDVKALGRCCVVSRRFHSLVPQVDNVVVRVDCVISDDDPSSNSSSAAASAAGDKSRHPISSLFRIFLSGLFKPLQSLSQLIIPSARRLPLSEDFDCEAEQNTVTHHSPTQVLKNFNEIKLLRIELPTGELGVDDGVLLKWKAEFGSTLDSCVILGASSVAQSANSSYSSSNDNGVESDNGSIPESFYTNGGLRLRVVWTISSLIAASARHYLLQPIIAEHKTLES...

XP_057763987.1
MGSIGADLCRKIYPEPVDEFDRLPDSLILLIFNQIGDVKALGRCCVVSRRFHSLVPQVDNVVVRVDCVISDDDPSSNSSSAAASAAGDKSRHPISSLFRIFLSGLFKPLQSLSQLIIPSARRLPLSEDFDCEAEQNTVTHHSPTQVLKNFNEIKLLRIELPTGELGVDDGVLLKWKAEFGSTLDSCVILGASSVAQSANSSYSSSNDNGVESDNGSIPESFYTNGGLRLRVVWTISSLIAASARHYLLQPIIAEHKTLES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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