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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000461`

染色体: Chr05 坐标: 3486025-3490371 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000461`
名称	SmilChr05G000461
描述	ornithine aminotransferase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3486025 - 3490371 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985182`
GeneID	`130985182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985182`
原始查询	`LOC130985182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ornithine aminotransferase, mitochondrial
产物	ornithine aminotransferase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G46180` (DELTA-OAT) ornithine-delta-aminotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834660] identity=75.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0643300` (OsOAT) - identity=71.1; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004587 (L-ornithine transaminase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010121 (GO:0010121); GO:0019544 (GO:0019544); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding); GO:0042802 (identical protein binding)
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00202 (Aminotran_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057763988.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057763988.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763988.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763988.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3486314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:3486600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:3486674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:3486687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B112,C7
`Chr5:3486761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr5:3487486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:3487495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:3488704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:3488705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B82
`Chr5:3488736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B69,B70,C21
`Chr5:3488781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:3488838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B78,B81,B98,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763988.1

475 aa

238

475

Aminotran_3

PF00202 Aminotran_3 48-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763988.1`	Pfam	`PF00202`	Aminotran_3	Domain	48	439	5.2e-121	404.8	Aminotransferase class-III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908005.1
ATTCCCCTGAAAAAACAGTAGCATTTTGATTTGTCAGTTGTCAGTTCCTTCTGGTTATTGATTATTGGGATTTTGGGAAAGTGTAATCCTACGAATTTATCCATTCCCAAAATAACAAAACTAATTAATTTCACGAATTAGATAACACTGAGAGTTGGAGCCTGCCAGCCAACTCATACATCATCATTCATATCCCGAATTGTAAGACACAGAATCATCCATTCATTAATCGAAGCCAGATTGTTTGATCCTAGGTTGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985182
ATGGCGTCCAAGAAAAATCTTCAGTATTTGGTGGGAGCAGCATGGAGGGCAAGAAACGTGAGGAGGTTGGCCACAGTTGCCCAAAGCAGCGCTTCCTCTCACTCTTCTCAACATCTCATCGACTTGGAATACCACCGCAGCGCCCACAATTACCATCCTGTTCCAGTTGTCTTCTCACAAGCCAAAGGATCATGTATCTGGGACCCAGAAGGCAACCGATATATCGACTTCCTCTCAGCTTATTCCGCAGTTAATCAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763988.1
MASKKNLQYLVGAAWRARNVRRLATVAQSSASSHSSQHLIDLEYHRSAHNYHPVPVVFSQAKGSCIWDPEGNRYIDFLSAYSAVNQGHGHPKIMKAMVEQAEKLTLSSRAFYNDIFPVFAERLTSMFGYDMVLPMNTGAEGVETALKLARKWGYLKKGIPRDEAIIVSCCGCFHGRTLAVISMSCDNEATRGFWPLLPGHLKVDFGDTAALEKIFKEKGDRIAGFLFEPIQGEAGVVIPPDGYLQAVRDLCSKYNILMIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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